HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for nucleotide sequence S of genotype G

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
******** ** ********* ************* ******* ***** ** *  **** ********* * ** ****
ATGGAGAACATCACATCAGGATTCCTAGGACCCCTGCTCGTGTTACAGGCGGGGTTTTTCTTGTTGACAAGAATCCTCAC
                     c                     c        t  g



        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
****** **** ************** *********************** *   **** *********** ********
AATACCGCAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGGGAGTGCCCGTGTGTCCTGGCCTAAATTCGC
      a                                           r  cr    g
                                                  a   a


       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
********* *********** ** ** *** ********** ********* ***** ********  ***********
AGTCCCCAACCTCCAATCACTCACCAATCTCCTGTCCTCCAACTTGTCCTGGCTATCGCTGGATGTGTCTGCGGCGTTTT
                     a  t  y   t          y         a               t
                                                    y


       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
************************************************* ************ * * *************
ATCATATTCCTCTTCATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTTGTTGGTTCTTCTGGACTATCAAGGTATGTTGCCCGTTTG
                                                 w            m



       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*** ****** ******** * ******** ****** ****************   ***********************
TCCTCTGATTCCAGGATCCTCGACCACCAGTACGGGACCCTGCAAAACCTGCACGACTCCTGCTCAAGGCAACTCTATGT
          t                   c



       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
****************** ***** ******  ****************************  * ***************
ATCCCTCATGTTGCTGTACAAAACCTTCGGACGGAAATTGCACCTGTATTCCCATCCCATCATCTTGGGCTTTCGCAAAA
                        t       a                            r  y



       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*********** **** ***** ********* ********************************** ************
TACCTATGGGAGTGGGCCTCAGTCCGTTTCTCtTGGCTCAGTTTACTAGTGCCATTTGTTCAGTGGTTCGTAGGGCTTTC
           t                    a
           c


       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** ****** ***** **** *** * ****** * *** * *** **** ******** **************** ***
CCCCACTGTCTGGCTTTCAGCTATaTgGATGATGTGGTATTGGGGGCCAAATCTGTACAACATCTTGAGTCCCTTTATAC
                        g t      a t     r   a                              t
                        r a      r r
                          r

       650       660       670       680
....:....|....:....|....:....|....:....|.
*******************   ** *  *********
CGCTGTTACCAATTTTCTTtTGTCTTTGGGTATACATCTAA
                   gct  y            t g