HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for nucleotide sequence S of genotype F

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
        *      **   *  **     *       *   * *   * **    *   *  *  * **   ***  *
ATGGAcAACATcACATCAGGACTCCTAGGACCCCTGCTCGTGTTACAGGCGGTGTGTTTCTTGTTGACAAAAATCCTCAC
     g g  ct                                           t  c  c     t  g     g  a
                                                       c


        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**  **    *  **  *** *  *  *  ***** ** ** * * * *           ****   * ******  * *
AATACCACAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGGGActACCCGGGTGTCCTGGCCAAAATTCGC
       ag  a        t                 g        a  a ac   a a
                                                  c
                                                  r

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
********  ******** * ** ** **  *******  *  ** * **  ***** * *  ** *  ** ** ** *
AGTCCCCAACCTCCAATCACTTACCAACCTCCTGTCCTCCAACTTGTCCTGGCTATCGtTGGATGTGTCTGCGGCGTTTT
                               t                    t     c



       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** ** * ***** ******** *  *  ***** ***** ***** **** **** *     ** **  ** **** **
ATCATCTTCCTCTTCATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTTGTTGGTTCTTCTGGACTATCAAGGTATGTTGCCCGTTTG
     a                                             g       c  g



       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
***                      ** *  ** ***   ****   ** * **   *  *** * *    * * ****
TCCTCTAcTTCCAGGATCcACGACCACCAGCACGGGACCaTGCAAAACCTGCACAACTCTTGCtCAAGGAACCTCTATGT
       a          t ta                ac    gg        g        a     c
                     c


       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* ***** ** ** * *   * *** * ***  ***  ****  *********** ** **      ** *** ****
TTCCCTCcTGtTGCTGTTCcAAACCcTCGGACGGAAACTGCACtTGTATTCCCATCCCATCATCtTGGGCTTTAGGAAAA
       t  c  t   a a     t           t     c                    c
                   m     y


       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* ********  ** * ****  ** ** *   *    **  * * ** ***     ** * ***   **  * *  ***
TACCTATGGGAGTGGGCCTCAGCCCGTTTCTCCTGGCTCAGTTTACTAGTGCAATTTGTTCAGTGGTGCGTaGGGCTTTC
                g               a       a                              c
                                t


       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*****  ** * ** **     *    ****   ****  ****  *  ** **            **     * **  *
CCCCACTGTcTGGCTTTTAGTTATATGGATGATCTGGTATTGGGGGCCAAATCTGTGCAGCATCTTGAGTCCCTTTATAC
     t   t              g                               a  a  c
                                                        t


       650       660       670       680
....:....|....:....|....:....|....:....|.
          ** *   *     *  * **
CGCTGTTACCAATTTTCTGTTATCTGTGGGTATCCATTTaA
                t        t       a    -g-
                                       -