HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for nucleotide sequence PreC of genotype E

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                          **      ** *  ***  * *   ***** * *  *  ** ***** *** **
ATGCAACTTTTTCACCTCTGCCTAATCATCTCTTGTTCATGTCCTACTGTTCAAGCCTCCAAGCTGTGCCTTGGGTGGCT
            g



        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** ** *****   * **     ** ***  ** ** *         *      **  ***   *     ** ** * **
TTgGGgCATGGACATTGACCCTTATAAAGAATTTGGAGCTaCTGTGGAGTTACTCTCGTTTTTGCCTTCTGACTTCTTTC
  a  a         c  t                     t c a            t        gaac  t  t a
                                                         a         gg
                                                                   c

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   *       *   *  *     *                 *    *      *          **     *
CTTCAGTAAGAGATCTTCTAGATACCGCCTCaGCTCTGTATCGGGATGCCTTAGAATCTCCTGAgCATTGTTCACCtCAC
ag  ca tca         t     t  ta t   t c t   a        g      t    a    tca    g  t
                               c     a                                      c


       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
          * * *          * *  * ***  *  *        *    **  **** **    **  *    *
CAcACtGCACTCAGGCAAGCCATTCTTTGCTGGGGgGAacTAATGAcTCTAGCTACCTGGGTGGGtGtaAATTTGGAAGA
  t  g  ta          tg  a g  t     a  ct t   taca   gc  a        g ct  c  ac c
     c                                tg g      t                  g
     a                                 a

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
        *    **     * **    ****  **   *      *               *  *  *  **   **
TCCAGCATCCAGGGACCTAGTaGTCAGTTATGTCAATACTAATATGGGCCTAAAGTTCAGGCAATTATTGTGGTTTCACA
c att    a  a  ttag  t  tga      t    a cccg   cat    a  t  a   c g           t
    a          a  t  g  a


       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  **     *     * **          *      * *     ** ** *  ** *     **   ******
TTTCTTGTCTCACTTTTGGAAGAGAAACCGTCaTAGAGTATTTGGTGTCTTTTGGAGTGTGGATTCGCACTCCTCCAGCT
c      ca t tg  c      c tgtt  tg       c     a  c                        aacc
                         c  a   t                                          tt
                                c

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** *  **    ********  *     *  *   *** **   * * *** *****               ***
TATAGACCACCAAATGCCCCTATCTTATCAACACTTCCGGAGAaTACTGTTGTTAGACGAAGAG------GCAGGTCCCC
  c     g a             c             t  a c       a        c
                                           t


       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*  * ** *   * **** ***  *  **   *  **  *** *   *** *  *  ****  *** *      *
TAGAAGAAGAACTCCCTCGCCTCGCAGACGAAGATCTCAATCGCCGCGTCGCAGAAGATCTCAATCTCcaGctTCcCAAT
c     c          a      c    c  g        a         c               ggtaa  tagc
                                                                       g



....:

GTTAG
    a