Dataset for protein Pol of genotype F
[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]
10 20 30 40 50 60 70 80 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** * : *:*: .:* * *. *.: ***::* *.** . * .****:* * :*. * MPLSYPHFRKLLLLDD--EAGPLEEELPRLADEgLNRRVAeDLNLQLPNVSIPWTHKVGNFTGLYSSTVPtFNPdWlTPS ee xxxxxxxxx n d h a h d x a sn s h l k t g x h v 90 100 110 120 130 140 150 160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** * :: .**::***:* *. :** ** : * **** *.***:* *****:: ** :***: *:** FPDIHLHQDLIsKCEQFVGPLTKNELRRLKLvMPaRFfPKvTKYFPmeKGIKPYYPehvVNHYFKTRHYLHTLWKAGILY n en h r i s y l ld dna q i s 170 180 190 200 210 220 230 240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| . .: :* ** *:** . *****: * : * *. *: : * ** ::** :* * ** ***.:*. KRESTRSASFCGSPYSWEQELQHGSTSlNDsKgHGTESlCaQSsGiLsRPSAGSsiQgKFQQSRLGLQqkQGqLANGKQG xx hx k i k r f t t lpaxt af s hn h t a r e 250 260 270 280 290 300 310 320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * . .::. * *.... .. :: *** : *. * : . : :. R-SGRlRSrVHTPTRWPvGVEpsGTgCanNlASRSASCFHQSAVREkaNPSLSTSKRHtSTGhAVELnsVPPGsVrSeGK si pw y s la m sts rysy i k t s eigket s ntm fhp sssp g qs g fh g l d p i dl k vd 330 340 350 360 370 380 390 400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * : *: : .* ** .: ::** *.::: * :*::* *:* .: :********** GSVfsCWWLQFRDtEPCSDYCLSHIINLLEDWGPCyEHGqHhIRTPRTPARVTGGVFLVDKNPHNTTESRLVVDFSQFSR sp nak x y d h e y k q lx n l x 410 420 430 440 450 460 470 480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| . . ** ** *************:** *** *******:**************.** * **:*. ** . *:* GtTRVSWPKFAVPNLQSLTNLLSSNLSWLSLDVSAAFYHLPLHPAAMPHLLVGSSGLSRYVARLSStSRIhD----HQHG n c pg n yn f 490 500 510 520 530 540 550 560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| : * *: * ::* :*:**: * *****:*****: **** ***: * ***:* **.*: *:**.****:** * * TmQNLHNSCSRNLYVSLLLLFqTlGRKLHLYSHPIILGFRKIPMGVGLSPFLLAQFTSAICSVVRRAFPHCLAFSYMDDL l d d t h m yk f x m x v x x 570 580 590 600 610 620 630 640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** : *:: : *:*:*:*:*::**.:******* * *: *.. * ***:*: *: : *:* .** **** VLGAKSVQHLESLYTAVTNFLLSVGIHLNTSKTKRWGYtLhFMGYVIGSWGsLPQDHIVhKiKdCFRKLPVNRPIDWKVC l aa n n a iq lxe s t x 650 660 670 680 690 700 710 720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ***:.*** .********* * :**:***** * * * * :* **.***.***** ***** QRIVGLLGFAAPFTQCGYPALMPLYaCITAKQAFVFSPTYKAFLCkQYMNLYPVARQRPGLCQVFADATPTGWGLAIGHQ t q ah n 730 740 750 760 770 780 790 800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| .* ******** :*******.***: : ***** **. ***********:.**** **.******.*****: *** RMRGTFVAPLPIHTAELLAACFARSRSGAklIGTDNSVVLSRKYTSFPWLLGCAANWILRGTSFVYVPSALNPADDPSRG ni tv r d 810 820 830 840 850 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***: ** : * **** **:* .* **: * ****:**** *: * RLGlYRPLLRLpFQPTTGRTSLYAdSPSVPSHLPdRVHFASPLHVAWRPP vf l r a r v dt k v |