HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for protein Pol of genotype E

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   :   :   * ::     . ::: ** : :  *  :* .:*:      .:* . *:*   *:**     *:   :.
MPLSYQHFRRiLLLDEE--AGPLEEELPRLADEDLNRRVAEDLNLQLPNVSIPWTHKVGNFTGLYSSTIPVFNPNWKTPS
     p  lsl    dg       d   h   a           fhv d                 tsl i   h    f
         k                                      t                   v


        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** **:: *:: :* ::*****:::                 :*    :* *.       ****: ****  **  * **
FPDIHLHQDIINKCEQFVGPLTVNEKRRLnLVMPARFFPISTKYLPLEKGIKPYYPDNVVNHYFQTRHYLHTLWKAGILY
  n         r                k i     y kv   f  d    s   e l               e
                                       n                                  q


       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
:*  :  **: *  *  *  : :             :     :     *. **. .  :    *** :*:   :   : *
KRETTRSASFcGSPYSWEQeLHHGAFLDGPSRM-GEESFHHQSSGIFSRPPVGSSIQSKHQKSRLGPQSQQRPLDrSQQG
    sh    f l     hd q   -------- --k v lk f  l        vp  ypq    s  h  s  gr
    a     y                                                       q


       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*  :       .      : :.                   .           :  . .        :.  *
RSgSIRAgVHSPTRRPFGVEPSGSRHAkNIASRSASCLHQSAVRKAAYPNHSTFERHSSSGHAVEfHNiPPSSAGSQSKR
  wc w wayp a   s m s     vnyv nk t       i      t a     a   rem lqsfssn tr  geg
       r    p              t l                                t     l     e    -
                           e s

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
     ** .**.    * .*:: : *  : *          :: * :**:. .* *   *** *: **** *:*   .**
PVfSCWWLQFRNSEPCSDYCLtHLVNLLEDWGPCTEHGkHHIRIPRTPARVTGGVFLVDKNPHNTAESRLVVDFSQFSRG
s-sp         k       s i              r y         i   i
- -                                   e
  v

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   : ****. *:  ***.: .  *: :.** .:.:    ***. :*:** ******  :**: . .   .::      :
SSRVSWPKFAVPNLQSLTNLLSSNLSWLSLDVSAAFYHLPLHPAAMPHLLVGSSGLSRYVARLSSNSRIINHQYGTLPNL
i                      d              i                              l       s
n                                                                            q


       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*:  *:.*    :* :::  :*   *.**:: ****:***:****** * **.*:******  ****** *:**:***:
HDSCSRNLYVSLMLLFKTFGRKLHLYSHPIIMGFRKIPMGVGLSPFLLAQFTSAICSVVRRAFPHCLAFSYMDDVVLGAK
     kd                       v                                                r



       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   ** :::*: ****:::**::*. : : ***.  :**  *. :*:***::*  ** :*:::**:.* :***. * :.*
SVQHLESLYTsVTNFLLSLGIHLNPNKTKRWGYSLnFMGYVIGSWGSLPQEHIRmKIKDCFRKLPVNRPIDWKVCQRIVG
ta    a   a             sh         h    i   f     d  kt
                                   q                 tl


       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**.*.***** *:***:*:*:. :  :** *** *.:**  **  *:*  *:* .**********.**.*  .  *  .
LLGFAAPFTQCGYPALMPLYACIQSKQAFTFSPTYKAFLCkQYlNLYPVARQRPGLCQVFADATPTGWGLAiGHQRmRGT
                  i t tha           t  yq  mt        s                 l    l
                                       rt  qd                          m    v
                                        n                                   i

       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  :*   : *:*:. *:* * :** ::**:********  :***:** :*.*:* ***: :* *.:  .***  *::*
FVAPLPIHTAELLAACFARSRSGAKLIGTDNSVVLSRKYTSFPWLLGCAANWILRGTSFVYVPSALNPADDPSRGRLGiy
    m                   n                                                     vs
                        t                                                      f


       810       820       830       840
....:....|....:....|....:....|....:....|....:
:  : * * . * :* :*      .   . * .:.**  * * *
RPLLRLPFqPTTGRTSLYAVSPSVPSHLPdRVHFASPLHVAWRPP
        r s              trp v            k
        h                    g
                             a