HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for protein Pol of genotype E

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   *   :   *:**    :* ::: ** * :  *  .* .:**      .** . *** .:*:**:    *:   :.
MPLSYQHFRRiLLLDEE--AGPLEEELPRLADEDLNRRVAEDLNLQLPNVSIPWTHKVGNFTGLYSSTIPVFNPNWKTPS
     p  lsl    d        d   h   a            hv d                 t l i  sh  p f
         k                  l                                             s


        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** ***: *:: .* ::******::.***.*  **.*:*  *:* *  :* *.**   : *****.**** ***  * **
FPDIHLHQDIINKCEQFVGPLTVNEKRRLNLVMPARFFPISTKYLPLEKGIKPYYPDNVVNHYFQTRHYLHTLWKAGILY
  n         r                k i        a   f  d    s   e l               e



       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
.*  :  *** *  * .*  : **.*   .: : *::     : *   *. **. .  ::  .*** :*.** *   : *
KRETTRSASFcGSPYSWEQELHHGAFLDGPSRM-GEESFHHQSSGIFSRPPVGSSIQSKHQKSRLGPQSQQRPLDrSQQG
    s     f l     hd    t v         klv lk f      s    vp eypq    s  h  s  gr
          y                           i                l          q
          w

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**  :     . ...  * * :** :    *           ..  * .:   :*  .*.        *.  *:
RSGSIrAgVHSPTRRPFGVEPSGSRHAkNIASRSASCLHQSAVRKAAYPNHSTFERHSSSGHAVEFHNIPPSSAGSQSKR
   c w way  aw  s m s   g vnyv nk         i        a     a p rtm lqs s n te  g--
       r    p              t s                                                ng
                           e

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
     ***.**.*: **:.*::.: * *: **** *   * :. * ****:***:*******:*: ******** *:.**
PVfSCWWLQFRNSEPCSDYCLTHLVNLLEDWGPCTEHGkHHIRIPRTPARVTGGVFLVDKNPHNTAESRLVVDFSQFSRG
--sp         k       s i              r y         i   i
s -                                   q


       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**:.****************** *:*:*******::* ***** :*:** ******  :**: . . * .::      :
SSRVSWPKFAVPNLQSLTNLLSSNLSWLSLDVSAAFYHLPLHPAAMPHLLVGSSGLSRYVARLSSNSRIINHQYGTLPNL
i                      d              i                          t   l   h   q
n                                                                    t       s


       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*:  *. *   ****:*:  .** **.**:* ********:****** * ****:******:******* *:******:
HDSCSRNLYVSLMLLFKTFGRKLHLYSHPIIMGFRKIPMGVGLSPFLLAQFTSAICSVVRRAFPHCLAFSYMDDVVLGAK
                                                                               r



       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   **::::*: ****::***::*. : *****.  ***  *.*:***** **  **  ***:** .* :***. * :.*
SVQHLESLYTSVTNFLLSLGIHLNpNKTKRWGYSLnFMGYVIGSWGSLPQeHIrmKIKDCFRKLPVNRPIDWKVCQRIVG
te    a   a             s          h    i         d  kl  q                   l
                        a          q                 ts
                                                      q

       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
************:***:*:*:. :  :** *** **:**  **  *:* .*:* .***************.:.  *  *
LLGFAAPFTQCGYPALMPLYACIQSKQAFTFSPTYKAFLCkQYlNLYPVARQRPGLCQVFADATPTGWGLAIGHQRmRGT
                  i t tha           t   q  mt        s                 m i  l
                        y               t   d        q                      i
                                        n                                   v

       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* :*   : *:*:***:* * :** :***:******** *:***:**  ***:* ***: :* *.:  .*** .*.**
FVAPLPIHTAELLAACFARSRSGAKLIGTDNSVVLSRKYTSFPWLLGCAANWILRGTSFVYVPSALNPADDPSRGRLGiy
    m                   n                       t                             vs
                        t                                                      f
                                                                               c

       810       820       830       840
....:....|....:....|....:....|....:....|....:
.* * * : . * .* :*. *   .   . *  *.**  *:* *
RPLLRLPFqPTTGRTSLYAVSPSVPSHLPdRVHFASPLHVAWRPP
        r s             atrp v            k
        h                    g
                             a