Dataset for protein Pol of genotype E
[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]
10 20 30 40 50 60 70 80 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| : : *:** :. ::: ** : : * .* .:** .** . *** .:*:**: *: :. MPLSYQHFRRiLLLDEE--AGPLEEELPRLADEDLNRRVAEDLNLQLPNVSIPWTHKVGNFTGLYSSTIPVFNPNWKTPS p l l d d h fh d t l i sh p f s 90 100 110 120 130 140 150 160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ***: *:: .* ::******::.***.* *:.*:* *:* * :* *.** : ****:.**** *** * ** FPDIHLHQDIINKCEQFVGPLTVNEKRRLNLVMPARFFPISTKYLPLEKGIKPYYPDNVVNHYFQTRHYLHTLWKAGILY n r k i a f d s e l e 170 180 190 200 210 220 230 240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| .* : *** * * .* : . . : : *. **. . :: *** :*. . * : * KRETTRSASFcGSPYSWEQeLHHGAFLDGPSRM-GEESFHHQSSGIFSRPPVGSSIQSKHQKSRLGPQSQQRPLDrSQQG s f l hd t v k v lk f vp eypq s h s gr y w 250 260 270 280 290 300 310 320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** : ... : :. * . . . :* . . :. *: RSGSIRAgVHSPTRRPFGVEPSGSRHAkNIASRSASCLHQSAVRKAAYPNHSTFERHSSSGHAVEFHNiPPSSAGSQSKR c w way a s m s vnyv nk i a p tm lqsfs n te - r p t s p e 330 340 350 360 370 380 390 400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** .**.. * .*:: : * : * :. * :**.. .*:* *** *: **** *:* .** PVfSCWWLQFRNSEPCSDYCLtHLVNLLEDWGPCTEHGkHHIRIPRTPARVTGGVFLVDKNPHNTAESRLVVDFSQFSRG --sp k s i r i i s - v 410 420 430 440 450 460 470 480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| : ****. *: ***.: . *: :.** .:.: ***. :*:** ****** :**: . . .:: : SSRVSWPKFAVPNLQSLTNLLSSNLSWLSLDVSAAFYHLPLHPAAMPHLLVGSSGLSRYVARLSSNSRIINHQYGTLPNL i d a i t l q n 490 500 510 520 530 540 550 560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *: *. * :* :.: .* *.**:* ********:****** * ****:******. ****** *:******: HDSCSRNLYVSLMLLFKTFGRKLHLYSHPIIMGFRKIPMGVGLSPFLLAQFTSAICSVVRRAFPHCLAFSYMDDVVLGAK k i l r 570 580 590 600 610 620 630 640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **::::*: ****::***::*. : :****. *** *.*:***** .* ** *:*:** .* :***. * :.* SVQHLESLYTSVTNFLLSLGIHLNPNKTKRWGYSLnFMGYVIGSWGSLPQEHIRmKIKDCFRKLPVNRPIDWKVCQRIVG t a a st h i d kt l a q tl 650 660 670 680 690 700 710 720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ************:***:*:*:. : :** *** *.:** ** *:* .*:* .**********.**.*.:. * . LLGFAAPFTQCGYPALMPLYACIQSKQAFTFSPTYKAFLCkQYlNLYPVARQRPGLCQVFADATPTGWGLAiGHQRmRGT i t tha t yq mt s l l t d m i n v 730 740 750 760 770 780 790 800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| :* : *:*:. *:* * :** ::**:******** :***:** ***:* ***: :* *.: .*** .*.** FVAPLPIHTAELLAACFARSRSGAKLIGTDNSVVLSRKYTSFPWLLGCAANWILRGTSFVYVPSALNPADDPSRGRLGiy m n vs t f 810 820 830 840 ....:....|....:....|....:....|....:....|....: . : * : . * .* :*. * . . * *.** * * * RPLLRLPFqPTTGRTSLYAVSPSVPSHLPDRVHFASPLHVAWRPP r s trp v k h g a |