HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for protein Pol of genotype E

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   :   :   *:**    :. ::: ** : :  *  .* .:**      .** . *** .:*:**:    *:   :.
MPLSYQHFRRiLLLDEE--AGPLEEELPRLADEDLNRRVAEDLNLQLPNVSIPWTHKVGNFTGLYSSTIPVFNPNWKTPS
     p  l l    d        d   h               fh  d                 t l i  sh  p f
                                                                          s


        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** ***: *:: .* ::******::.***.*  *:.*:*  *:* *  :* *.**   : ****:.**** ***  * **
FPDIHLHQDIINKCEQFVGPLTVNEKRRLNLVMPARFFPISTKYLPLEKGIKPYYPDNVVNHYFQTRHYLHTLWKAGILY
  n         r                k i        a   f  d    s   e l               e



       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
.*  :  *** *  * .*  : . .           :     :     *. **. .  ::   *** :*. . *   : *
KRETTRSASFcGSPYSWEQeLHHGAFLDGPSRM-GEESFHHQSSGIFSRPPVGSSIQSKHQKSRLGPQSQQRPLDrSQQG
    s     f l     hd    t v         k v lk f           vp eypq    s  h  s  gr
          y
          w

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**  :       ...    : :.       *           .   . .    :*  . .        :.  *:
RSGSIRAgVHSPTRRPFGVEPSGSRHAkNIASRSASCLHQSAVRKAAYPNHSTFERHSSSGHAVEFHNiPPSSAGSQSKR
   c w way  a   s m s     vnyv nk         i              a p  tm lqsfs n te    -
       r    p              t s                           p
                           e

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
     ** .**..   * .*:: : *  : *          :. * :**.. .*:*   *** *: **** *:*   .**
PVfSCWWLQFRNSEPCSDYCLtHLVNLLEDWGPCTEHGkHHIRIPRTPARVTGGVFLVDKNPHNTAESRLVVDFSQFSRG
--sp         k       s i              r           i   i
s -
  v

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   : ****. *:  ***.: .  *: :.** .:.:    ***. :*:** ******  :**: . .   .::      :
SSRVSWPKFAVPNLQSLTNLLSSNLSWLSLDVSAAFYHLPLHPAAMPHLLVGSSGLSRYVARLSSNSRIINHQYGTLPNL
i                      d a            i                          t   l       q
n


       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*:  *. *    :* :.:  .*   *.**:* ********:****** * ****:******. ****** *:******:
HDSCSRNLYVSLMLLFKTFGRKLHLYSHPIIMGFRKIPMGVGLSPFLLAQFTSAICSVVRRAFPHCLAFSYMDDVVLGAK
     k   i                     l                                               r



       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   **::::*: ****::***::*. : :****.  ***  *.*:***** .*  **  *:*:** .* :***. * :.*
SVQHLESLYTSVTNFLLSLGIHLNPNKTKRWGYSLnFMGYVIGSWGSLPQEHIRmKIKDCFRKLPVNRPIDWKVCQRIVG
t     a   a             st         h    i         d  kt                      l
                        a          q                 tl


       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
************:***:*:*:. :  :** *** *.:**  **  *:* .*:* .**********.**.*.:.  *  .
LLGFAAPFTQCGYPALMPLYACIQSKQAFTFSPTYKAFLCkQYlNLYPVARQRPGLCQVFADATPTGWGLAiGHQRmRGT
                  i t tha           t  yq  mt        s                 l    l
                                        t   d                          m    i
                                        n                                   v

       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  :*   : *:*:. *:* * :** ::**:********  :***:**  ***:* ***: :* *.:  .*** .*.**
FVAPLPIHTAELLAACFARSRSGAKLIGTDNSVVLSRKYTSFPWLLGCAANWILRGTSFVYVPSALNPADDPSRGRLGiy
    m                   n                                                     vs
                        t                                                      f


       810       820       830       840
....:....|....:....|....:....|....:....|....:
.  : * : . * .* :*. *   .   . *  *.**  * * *
RPLLRLPFqPTTGRTSLYAVSPSVPSHLPDRVHFASPLHVAWRPP
        r s              trp v            k
        h                    g
                             a