HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for protein Pol of genotype D

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
           : *: .  :*. :.  .     .     .                .    : *: . .   : .
MPLSYQHFRrLLLLDDE--AGPLEEELPRLADEgLNRRVAEDLNLG-NLNVSIPWTHKVGNFTGLYSSTVPVFNPHW-KT
      r  k v  end           h    d       e     dpt n        s       si i   n
               e                               t





        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  *  *.*    : .*  :   *:      :     :      *: :*   **...*    *    :       * : *
PSFPNIHLHQDIIKKCEQFVGPLTVNEKRRLQLIMPARFYPnVTKYLPLDKGIKPYYPEHLVNHYFQTRHYLHTLWKAGi
t        n  nr  h      i      k         kf                 v d    a     i  q  v
             e                            a                 i





       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   . .     *      .:    **             ..   .  : .  . *. .  .   . :* .  :  :
LYKRETThSASFCGSPYSWEQeLQHGA-----------ESFHQQSSGILSRPPVGSSLQSKHrKSRLGLQSQQGHLARRQ
     s r       s t   dih                v         gs   p    eysqp   f     pm kc
               l     k r                                      q
                                                              c
                                                              h



       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
: .         .
QGRSWSIRAGiHPTaRRPFGVEPSGSGHtTNlAsKSASClyQSPVRKAAYPaVSTFEkHSSSGHAVElHNLPPNSARSQs
   gr l trf  at  svrm  as r nahf nr t  ih  sdgttthssd  s ryap srt dfn fsssat   g
    g     v   s             a  r r     f      e  d t   v   p   n    q i
          t                            s




       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
                .*   .        .   .    *    .        :**:  .: .      . *: * .
ERPVFPCWWLQFRNSKPCSDYCLShIVNLLEDWGPCaEHGEHHIRIPRTPaRVTGGVFLVDKNPHNTAESRLVVDFSQFS
g -ss    n  s e    h   l i         t   k    t    s             r  e
w i-        d                      v                              k
                                    d                              t




       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*       .:*:.  : ::.:  *     *  . *.  : .*  * :.  :: . * .    * .
RGnyRVSWPKFAVPNLQSLTNLLSSNLSWLSLDVSAAFYHLPLHPAAMPHLLVGSSGLSRYVARLSSNS--RIfNh---Q
  dh                     d   i          i     s            g    v yd     ldy
  kd                                                              t      i n
  h                                                                      v




       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
      :    :  .     :*  .  .*:* **.*:  .: **.  :  **:  .: : :: . :.      : :   *
hGTMqNLHDsCSRNLYVSLLLLYQTFGRKLHLYSHPIILGFRKIPMGVGLSPFLLAQFTSAICSVVRRAFPHCLAFSYMD
r ilpdm  y   h  e  m   k l w   m     vm               m                       i
     h                     q                                                  v





       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
    **        :   :  ** .: :.:*  **  **  *   *  :   *. .* **   :     : *    :* :
DVVLGAKSVQHLESLFTAVTNFLLSLGIHLNPNKTKRWGYSLhFMGYVIGcYGSLPQdHIiqKIKECFRKLPvNRPIDWK
       tas   a y       f v v    h       h n    s  sw     e  rh l d      i
         p                      t                 gh        vl
         h                                                  k




       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
: :*. . *   *** *  **.: .       ..   :    : *   :     *   :  .: : : :.**.   :  *
VCQRIVGLLGFAAPFTQCGYPALmPLYACIQSKQAFTFSPTYKAFLCKQYLNLYPVARQRPGLCQVFADATPTGWGLVMG
                       k     thar      ap  t  yq  mt        s                ai






       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   :..       **  *  :**** **  *   . *   ::**: *: ***:*  *:  *.  *:: *    **
HQRMRGTFlAPLPIHTAELLAACFARSRSGANIlGTDNSVVLSRKYTSfPWLLGCAANWILRGTSFVYVPSALNPADDPS
        s                       li              y      t
        q                       v
        r
        p
        v
        m

       810       820       830       840       850
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:..
   **  *.       ..**. * *.    *   *.                  .
RGRLGLsRPLLRLPFRPTTGRTSLYADSPSVPSHLPDRVHFASPL--HV--AWRPP-
     iy   ic   q          a         v                k
     pf
      c
      a