Dataset for nucleotide sequence PreS1 of genotype H
[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]
10 20 30 40 50 60 70 80 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ****** ********** ***** ******** *********** ** ***************************** ** ATGGGAGCACCTCTCTCaACGGCGAGAAGGGGCATGGGACAGAAtCTTTCTGTGCCCAATCCTCTGGGATTCTTTCCAGA t c r y c c m a t y g 90 100 110 120 130 140 150 160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ************* ************* ***************** ************ ** ************** *** CCACCAGTTGGATCCACTATTCAGAGCAAATTCCAGCAGTCCCGATTGGGACTTCAACACAAACAAGGACAATTGGCCAA v c c g g g 170 180 190 200 210 220 230 240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **************** ***** *** ***** ***** *********** ***** ******************** TGGCAAACAAGGTAGGAGTGGGAGGCTTCGGTCCAGGGTTCACACCCCCACACGGTGGCCTTCTGGGGTGGAGCCCTCAG ca c c t c t t g a 250 260 270 280 290 300 310 320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** ****** * ******* ****** * *** ***** ******* ** *** *********** * ******** GCACAGGGCATTCTgACAACCTcGCCACCAGATCCACCTCCTGCTTCCACCAATCGGAGGTCAGGAAGAAAGCCAACCCC r a a t c t w c a c a gm a t c 330 340 350 360 370 380 390 400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ***** ********** * *********** * * * ** *** * * ** AGTCTCTCCACCTCTAAGGGACACACATCCACAGGCCATGCAGTGGAACTCAACACAGTTCCACCAAGCACTGTTGGATC a t ac g nnnygnnnnnnnnnnnnnnct ag ca aca tc a c a ct nn m 410 420 430 440 450 460 470 480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** *** ***** ********************* ******* * ** ** ********** ******* CGAGAGTaAGGGGtCTGTATtTTCCTGCTGGTGGCTCCAGTTCAGAAACACAGAACCCTGCTCCGACTATTGcCTCTCTC a g g------c-- a a g y tg t c g - 490 500 510 520 530 540 550 560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **** **** ******** ********* **** ******** *********************** ********* ACATCATCAATCTTCTCGAAGACTGGGGACCCTGcTATGAACATGGAGAACATCACATCAGGACTCCTAGGACCCCTTCT g g c m t tyc a a c 570 580 590 600 610 620 630 640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *********** ***** ***** ********** *** ********* ***************************** CGTGTTACAGGCGGTGTgTTTCTTGTTGACAAAAATCCTCACAATACCAcAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCA g t c g k cag g 650 660 670 680 690 700 710 720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ********* ***************************** ************************** ** *** ****** ATTTTCTAGGGGTACCACCCGGGTGTCCTGGCCAAAATTCGCAGTCCCCAATCTCCAATCACTTACCAACCTCCTGTCCT a y a t t 730 740 750 760 770 780 790 800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ********************* *************************************** ******* **** * CCAACTTGTCCTGGCTATCGTTGGATGTGTCTGCGGCGTTTTATCATCTTCCTCTTCATCCTGCTGCTATGCCTCATCTT c g g tca cg 810 820 830 840 850 860 870 880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ** ************************************************ **************** * CTTGTTGGTTCTTCTGGACTATCAAGGTATGTTGCCCGTGTGTCCTCTACTTCCAGGATCtACAACCACCAGCACGGGAC t cct gtg at t wc 890 900 910 920 930 940 950 960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******* *********** * ********** ******** ******* ** ** **** ****************** CCTGCAAAACCTGCACCACTCTTGCTCAAGGAACCTCTATGTTTCCCTCCTGCTGCTGTACCAAACCTTCGGACGGAAAT g g y c c t t t ta 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *********************** *********** ***** *********** ******************** ***** TGCACCTGTATTCCCATCCCATCATCTTGGGCTTTCGGAAAATACCTATGGGAGTGGGCCTCAGCCCGTTTCTCTTGGCT g a t t a c 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *********** ** ***** *************** ********** *** **** ** * *** ******** **** CAGTTTACTAGTGCAATTTGtTCAGTGGTGCGTAGGGCTTTCCCCCACTGTCTGGCTTTTAGTTATATGGATGATtTGGT c c c a t t c cg c g c g 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ****************** ** ********* ** ********************************************* ATTGGGGGCCAAATCTGTGCAGCATCTTGAGTCCCTTTATACCGCTGTTACCAATTTTTTGTTATCTGTGGGCATCCATT a a g a ... * * TgA a r |