Dataset for nucleotide sequence P of genotype F
[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]
10 20 30 40 50 60 70 80 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ****** **** **** ***** ** * * * * * * ** ATGCCCCTATCcTATCCACACTTCCGGAAACTACTGTTGTTAGACGACG------AGGCAGGTCCCCTaGAAGAAGAACT t gt g a ga a c annnnncnnnnnnnnnnn c t n 90 100 110 120 130 140 150 160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ****** *** * * * * * * **** ******* * ** ***** ** ** CCCTCGCCTCGCaGACGAAGgTCTCAATCGCCGCGTCGCAGAAGATCTCAATCTCCAGCTTCCCAATGTTAGTATTCCTT nnnnnnnn ca a a g cac t gc 170 180 190 200 210 220 230 240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * *** * * ** ** ** ** ****** ** * *** * * ** * ** * GGACTCATAAGGTGGGAAAtTTTACGGGgCTcTAtTCtTCTACTGTtCCTaCTTTtAATCCTgACTGGTTAACTCCTTCT c k c a a t c c a g c t a t gcc g g r c g 250 260 270 280 290 300 310 320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** * ***** * ** * * ** * ** ** * * ** ** ** * ** * * ** TTTCCTGAtATTCATTTaCATCAAGAtcTGATAtctAAATGTGAACAATTTGTAGGCCCtCTcACaAAAAATGAATTgAG a c g cg ga ct a tcac g g t a t c ac a g a t 330 340 350 360 370 380 390 400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** *** * * ***** * * * * * ** * ** ***** ** * * ** * ** ** ** AAGaTTaAAATTggTtATGCCAgCcAGATTtTtTCCTAAggTTACcAAATAtTTTCCTaTGGAaAAaGGaATtAAACCcT g g g aa c t t c a ac c t c cc a g g c c g t a t c g t t 410 420 430 440 450 460 470 480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * **** * * *********** ** * * ** *** * *** * *** * ** **** ATTATCCTGAgcAtGcaGTTAATCATTAtTTTAAgACcAGACAtTATTTGCATACTTTATGGAAgGCgGGaATttTATAT a ta cttg c c a a c c t a a c cc y r t r r y 490 500 510 520 530 540 550 560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * ** * ** ** ** ** * ** * ****** ** * **************** AAGAGAGAATCCACACGTAGCGCCTCATTTTGTGGGTCACCATATTCcTGGGAACAAGAGCTACAGCATGGGAGCACCTC r r r c a a t a 570 580 590 600 610 620 630 640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * *** ** * * * ***** * ** ***** ** ***** *** * ** * ***** ***** TcTCAACGACacGAAGgGGCATGGGACaGAATCTcTCTGTgCCCAATCCtCTGGGaTTCTTtCCAGACCATCAGCTGGAT a ta a t t a a c c g r a g g 650 660 670 680 690 700 710 720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * **** ** ** *** ** * ** ***** ****** ****** ********* * ***** ** CCtCTaTTCAGgGCAAATTCCAGCAGTCCCGAcTGGGACTTCAACAaAAACAAGGACAaTTGGCCAATGGCAAACAAGGT g t aa a t c gc c g 730 740 750 760 770 780 790 800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** * * ** * * ** ** ***** *** * * ** * *** ** * ** ** ** AGGAG---TGGGAGGaTACGGTCCaGGGTTCACACCCCCACACGGTGGCCTGtTGGGGTGGAGcCCtCAGGCACAgGGTG g ct c t t t t c a t a a a a c c 810 820 830 840 850 860 870 880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** * ** * ** *** * ********* * * * * * TgcTaACAACcTTGCCAGCAGATCCGCCTCCTGCTTCCACCAATCGGCGGTCCGGGAGaAAgCCAACCCCAGTCTCTCCA tt t a tga a cc a aa g a g a c g r 890 900 910 920 930 940 950 960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** ** ** ** ** * * ** ** CCTCTAAGAGACACaCATCCACAGGCcATGCAGTGGAACTCaACtCAGTTCCACCAGGCtCTGTTaGATCCgAGGGTAAG g t ag a a ta ct c t t aa ct g c c aa a c a 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** * * * *** **** GGCTCTGTAttTtCCTGCTGGTGGCTCCAGTTCAGaGACaCAGAACCCTGCTCCGACTATTGCCTCTCTCACATCATCAA -----cc-c ga g a t y t g-- - 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ***** * ** ** * ** ** * * ** ** ** ** ** * * * * TCTTCTcGAAGACTGGGGGCCCTGCTAtGAACATGGAcAACATCACATCAGGACTCCTAGGACCCCTGCTCGTGTTACAG c c t c c t c c g g ctt a a a a a 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * * ** * * ** *** ** ** *** * ** *** ** ***** ***** ** ****** * GCGGTGTGTTTCTTGTTGACAAAAATCCTCACAATACCACAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGG t c c t g a g g g a c 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * ***** ** ****** * * *********************** ***** ******* * ***** GGGActACCCGGGTGTCCTGGCCAAAATTCGCAGTCCCCAACCTCCAATCACTTACCAACCTCCTGTCCTCCAACTTGTC a ac a r c 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ***** * * ** ** ** ***** ****** ******* *********** ******** ************* CTGGCTATCGtTGGATGTGTCTGCGGCGTTTTATCATCTTCCTCTTCATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTTGTTGGTT t c 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** **** * ***** ******** ***** * * *** *** ** CTTCTGGACTATCAAGGTATGTTGCCCGTTTGTCCTCTAcTTCCAGGATCcACGACCA------------CCAGCACGGG g c g a tt a - a a 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * **** **** ** ** **** * * ** * **** * ***** ** ** *** * * *** * *** **** ACCaTGCAAAACCTGCACAACTCTTGCTCAAGGAACCTCTATGTTTCCCTCcTGtTGCTGTTCcAAACCcTCGGACGGAA c g g a c t c t a a t a m y 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ***** *********** ***** ** ** *** ***** * ******** ** * **** ** ** *** * * ACTGCACtTGTATTCCCATCCCATCATCtTGGGCTTTAGGAAAATACCTATGGGAGTGGGCCTCAGCCCGTTTCTCCTGG c c s t a 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **** ******* *** * ** ***** * ** * * ********* *** **** ** * **** * ** CTCAGTTTACTAGTGCAATTTGTTCAGTGGTGCGTAGGGCTTTCCCCCACTGTcTGGCTTTTAGTTATATGGATGATCTG a c t t g k 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** **** ** *** ** * * * ** * * ** * * ** * ***** * **** **** ** * GTATTGGGGGCCAAATCTGTGCAGCATCTTGAGTCCCTTTATACCGCTGTTACCAATTTTCTGTTATCTGTGGGTATCCA t a c t t 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * * ** ** ** * ***** ** * * ** ** * * ** * ** ** * ** * TTTaAATACcTCtAAAACaAAAAGATGGGGTTAcacccTAcATTTcATGGGTTATGTtATTGGcAGTTGGGGAtCaTTAC g cg tg g g gc c ttatt ca t a c t g g g t a c a a a 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * ** ** * ** * * * * *** * *** ** ** * ** ***** ** ** CcCAAGATCAcATTGTACAcAAAaTCAAAGAtTGTTTTcGtAAACTTCCTGTAAATCGtCCaATTGAtTGGAAAGTTTGT a t a t a gc rg a c a a g c t a c c c t c g a c a 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * ** ** * *** ** ** ** * * * ***** ** ** ** *********** * ** CAaCGcATTGTGGGtCTTTTGGGCTTTGCcGCcCCtTTtACcCAATGTGGTTATCCTGCTCTCATGCCTcTGTATgCCTG g t a a c t t c c t c t a caat g a a 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * ** ** * ** ***** ** **** ** * ** ***** ** ** **** * *** * TATaACTGCtAAACAGGCTTTTGTCTTTTCGCCAACTTACAAGGCCTTTCTaTGTaAACAaTACATGAACCTTTACCCCG t c g g t c c a c c g gc c c c a g 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ******** * *** * ********** ****** ** ** *** TTGCTCGGCAACGGCCAGGCCTGTGCCAAGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCTTGGCCATTGGCCATCAG ca g t t c 2170 2180 2190 2200 2210 2220 2230 2240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * *** ****** * ******* * * ** ** ** * ** ** ** *** ** * *** CGCATGCGTGGAACCTTTGTGGCTCCTCTGCCGATCCATACTGCGGAACTCCTTGCAGCtTGTTTCGCTCGCAGCCGGTC a a a c c a 2250 2260 2270 2280 2290 2300 2310 2320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** * * * ** ** * ** * * ** * * ** ** * ** ** *********** ** ** TGGAGCGAaacTcATCGGcACaGACAACTCTGTTGTCCTCTCTaGGAAGTACACCTCCTTcCCATGGCTGCTCGGtTGTG agcta t g g t c a cc t a gcg m g c 2330 2340 2350 2360 2370 2380 2390 2400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ** ***** ** * ** **** ***** ***** ** ** * ********* ** ***** * ** **** CTGCcAACTGGATCCTgCGCGGGACGTCCTTTGTTTACGTCCCGTCGGCGCTGAATCCcGCGGACGAcCCCTCtCGGGGt a a a a a t t c c t 2410 2420 2430 2440 2450 2460 2470 2480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * ** * * ** ** * * ** * *** ** ** ***** * ****** * ***** * * ** CGCTTGGGGcTgTAcCGCCCcCTTCTcCGTCTGCCGTTCCAGCCgACgACGGGTCGCACCTCTCTTTACGCGGaCTCCCC tc a ag c tt t g a t g a c c a t a t 2490 2500 2510 2520 2530 2540 2550 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|... *** *** * * **** ************ *************** **** ** ** *** GTCTGTTCCTTCTCATCTGCCGGaCCGTGTGCACTTCGCTTCACCTCTGCACGTCGCATGGAGACCACCGTGA g g t a a a |