HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for protein Pol of genotype G

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*****************:* *********: . * *:******:*** ********************************
MPLSYQHFRRLLLLDEEAGPLEEELPRLADEDLNRRVAEDLHLQLPNVSIPWTHKVGNFTGLYSSTIPVFNPDWQTPSFP
                 t l         epsp s i      k   d


        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
************************   :********************** **********************:******
NIHLHQDIITKCEQFVGPLTVNEKRRLKLVMPARFFPNSTKYLPLDKGIKPYYPENVVNHYFQTRHYLHTLWKAGILYKR
                        ---q                      -                      t


       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
************************************:**** * ********:***********************.**
ETSRSASFCGSPYTWEQDLQHGAFLDGPSRVGKEPFHQQSSRIPSRSPVGPSIQSKYQQSRLGLQSQKGPLARGQQGRSW
                                    r    g l        l                       s  r


       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** ********** *****:*******:**** *********** *****:******* ** *:.:*******:**
SLWTRVHPSTRRPFGVEPSVSGHTNNFASRSASCLHQSSVREAAYSHLSTTKRQSSSGHAVELYSIPPSSTKSQSQGPVf
  r          s     i       t    h           d     s       p  - hpv       h  ---s
                                                                               -

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*********:..**:*****::***:*******:**:*** ********** * ***  ***:*****************
SCWWLQFRDSEPCSDYCLSHLVNLLQDWGPCTEHGEHHIRIPRTPARVTGGVFLVDKNPHNTAESRLVVDFSQFSRGSAR
         trt  e     ii   e       y  y   t          g r   il   t


       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
************************:**** *******************************.* ***.**:******* *
VSWPKFAVPNLQSLTNLLSSNLSWLSLDVSAAFYHIPLHPAAMPHLLVGSSGLSRYVARLSSDsRILDHQYGTLQNLHDS
                        i    f                               p f   h  h       v
                             a

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*****************:*******************:******:***********************:***********
CSRQLYVSLMLLYKTFGRKLHLYSHPIILGFRKIPMGVGLSPFLlAQFTSAICSVVRRAFPHCLAFSYmDDVVLGAKSVQ
                 q                   l      m                       i
                                                                    v

       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*****:*******:*******  ********* *****************::*** ** ****************.****
HLESLyTAVTNFLLSLGIHLNpNKTKRWGYSLNFMGYVIGSWGTLPQEHITQKIKQCFRKLPVNRPIDWKVCQRITGLLG
     f       f       ht         x                 ak   x  g                v
                      d

       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*********************.****************** ***************************************
FAAPFTQCGYPALMPLYACIQAKQAFTFSPTYKAFLCKQYMNLYPVARQRPGLCQVFADATPTGWGLAIGHQRMRGTFVA
                     v                  r
                                        l

       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*******:* ***********.******************* *****   * ********:********* ****: ***
PLPIHTAELLAACFARSRSGAKLIGTDNSVVLSRKYTSFPWLLGCAANWILRGTSFVYVPSALNPADDPSRGRLGLCRPL
       d r           t                   q     tst s        t         w    iy
         i                                     i

       810       820       830       840
....:....|....:....|....:....|....:....|..
***.***.*****:**** *************** *******
LRLPFLPTTGRTSLYAVSPSVPSHLPDRVHFASPLHVTWKPP
   s   p     i    r               s