HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for protein Pol of genotype A

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  ***  :   ::.       * : :     *     : :    .*     .:. * : *.  ** *   .     *. *
MPLSYQHFRKLLLLDDgT-EAGPLEEELPRLADaDLNRRVAEDLNLGNLNVSIPWTHKVGNFTGLYSSTVPIFNPEWQTP
        l      vea dv    d       e   h          p                   s  v   d
               e                                                       n
               n                                                       s



        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** * *:  :                                            :      *::   :*:. *     :
SFPKIHLqEDIiNRCQQFVGPLTVNEKRRLKLIMPARFYPthTKYLPLDKGIKPYYPDqVVNHYFQTRHYLHTLWKAGIL
       h   ad  e       a              f ns   f  h        ehi     ka           v
           s
           v



       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
        :    :    **               .         *:  :.   . :     :     :  :
YKRETTRSASFCGSPYSWEQELqHGRLVikTSQRHGDEsFCSQpSGILSRSSVGPCIRSQlKQSRLGLQPHQGPLAsSQp
    s                 hq---dtqa       pi pksa  p      sg    f  a     sr rs  tg s
                           -sn         v               r                    n
                            --
                             e


       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
       .              .               : :.
GRSGSIRaRaHpsTRRyFGVEPSGSGHIdhSvnnSSSCLHQSAVRKAAYSHLSTSKR--QSSSGHAVEFHclPPSSAgSQ
g   fwp v sp   cs       r vgyiassa h  r   d tt ht f        p   rt dl sfssnatr
                 l         t nf g          a                    n     n     e




       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
          . *    **    :       .         .  *    :*  :*. :::*  .*:*  : :**  *
SQGsVfSCWWLQFRNskPCSeYCLSHLVNLrEDWGPCdEHGEHHIRIPRTPARVTGGVFLVDKNPHNTAESRLVVDFSQF
g  p sp        tq   k  i  i   ld     ad       t k                   t
                    n                tn
                    q                v
                                     f
                                     g

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
:    *  .:** ** ::**::  . * *.: *. **.  :****: **.*:: * .*   :  *:    :    .
SRGiTRVSWPKFAVPNLQSLTNLLSSNLSWLSLDVSAAFYHIPLHPA-AMPHLLIGSSGLsRYVARLSSNSRInNNQyGT
   ls                                                 v ta  pg          nh heh n
   t
   v
   s
   x

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  .:*   :   * .::**    * : *    *  :.  *   *:. **  :.:  .          *  :.  * :* :
mQNLHDSCSRQLYVSLMLLYKTYGwKLHLYSHPIvLGFRKIPMGVGLSPFLlAQFTSAICSVVRRAFPHCLAFSYmDDVV
l d             l   q   r         i                m      l                v  i
                                                                              l




       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  :    *   :      *:   * ::.  *  : ** *    : *  *  :*:         *:   * :   **: **
LGAKSVQHrEsLYTAVTNFLLSLGIHLNPNKTKRWGYSLNFMGYiIGSWGTLPQDHIVQKIKhCFRKLPVNRPIDWKVCQ
    ta  l a f                          h    v     s   e  i  l n      i   v
                                                              c
                                                              q



       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
: .:*.:  . :**  **  ** : : :.::   *   ..:*   *
RIVGLLGFAAPFTQCGYPALMPLYACIQAKQAFTFSPTYKAFLSkQYMNLYPVARQRPGLCQVFADATPTGWGLAIGHQR
                             r             nq  ld        s
                                           rt




       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
           : .                                  ::    * :*  *      * :*    **
MRGTFVAPLPIHTAELLAACFARSRSGAKLIGTDNSVVLSRKYTSFPWLLGCTANWILRGTSFVYVPSALNPADDPSRGR
                            n                       a
                            t
                            r



       810       820       830       840
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....
     ***   :             * **   .       *
LGLsRPLLRLPfqPTTGRTSLYAVSPSVPSHLPvRVHFASPLHVAWRPP
   y       yr s        d         d    d       k