Dataset for protein Pol of genotype A
[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]
10 20 30 40 50 60 70 80 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** : ::.: * : : * : : .* .:. * : *. **** . *. * MPLSYQHFRKLLLLDDgT-EAGPLEEELPRLADaDLNRRVAEDLNLGNLNVSIPWTHKVGNFTGLYSSTVPIFNPEWQTP l vea dv d e h p s v d e s n 90 100 110 120 130 140 150 160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * *: .: : *:: :*:. * : SFPKIHLqEDIiNRCQQFVGPLTVNEKRRLKLIMPARFYPthTKYLPLDKGIKPYYPDqVVNHYFQTRHYLHTLWKAGIL h ad e a ns f h ehi ka v s v 170 180 190 200 210 220 230 240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| : : : ** . : *: :. . : : : : : YKRETTRSASFCGSPYSWEQELqHGRLVikTSQRHGDEsFCSQpSGILSRSSVGPCIRSQlKQSRLGLQPHQGPLAsSQp s h----dtqa pi pksa p sg f sr rs t s -sn v r n -e 250 260 270 280 290 300 310 320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| . . : :. GRSGSIRARaHpsTRRyFGVEPSGSGHIdhSvnnSSSCLHQSAVRKAAYSHLSTSKR--QSSSGHAVEFHclPPSSAgSQ g wp v sp cs vgyiassa h r d tt ht f p rt dl sfssnatr l t nf g a n n e 330 340 350 360 370 380 390 400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| . * ** :: . *** . * :* :*. :::* *.*:* : :*** * SQGsVfSCWWLQFRNskPCSeYCLSHLVNLrEDWGPCdEHGEHHIRIPRTPARVTGGVFLVDKNPHNTAESRLVVDFSQF g p sp tq k i i ld ad t k t n tn q v f g 410 420 430 440 450 460 470 480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| : * *.:** ** :****: . * *:* *. *** *:****: **.*:: * .* : *: : . SRGiTRVSWPKFAVPNLQSLTNLLSSNLSWLSLDVSAAFYHIPLHPA-AMPHLLIGSSGLSRYVARLSSNSRInNNQyGT ts v ta pg nh h h n l v s x 490 500 510 520 530 540 550 560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| .:* :. * .::** * : *: * :. * *:. ** :.: . * *: :.: * :* : mQNLHDSCSRQLYVSLMLLYKTYGwKLHLYSHPIvLGFRKIPMGVGLSPFLlAQFTSAICSVVRRAFPHCLAFSYmDDVV l d l q r i m v i l 570 580 590 600 610 620 630 640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| : * : *: * ::.. * : ** * : : * * :*: *: * : **: ** LGAKSVQHrEsLYTAVTNFLLSLGIHLNPNKTKRWGYSLNFMGYiIGSWGTLPQDHIVQKIKhCFRKLPVNRPIDWKVCQ ta l a f h v s i l n i v c q 650 660 670 680 690 700 710 720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| : .:*.: . :** *** ** : :::.:: * ..:* * RIVGLLGFAAPFTQCGYPALMPLYACIQAKQAFTFSPTYKAFLSkQYMNLYPVARQRPGLCQVFADATPTGWGLAIGHQR r nq ld s rt 730 740 750 760 770 780 790 800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| : . :: * :* * * :* ** MRGTFVAPLPIHTAELLAACFARSRSGAKLIGTDNSVVLSRKYTSFPWLLGCTANWILRGTSFVYVPSALNPADDPSRGR n a t r 810 820 830 840 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:.... *** : * ** . * LGLsRPLLRLPfqPTTGRTSLYAVSPSVPSHLPvRVHFASPLHVAWRPP y yr s d d d k |