HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for protein Pol of genotype A

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  ***  *   ::.:      * : :   * *     . :.   :*    *.:. * : *.  ****   .     *  *
MPLSYQHFRKLLLLDDgT-EAGPLEEELPRLADaDLNRRVAEDLNLGNLNVSIPWTHKVGNFTGLYSSTVPIFNPEWQTP
        l      vea  v    d       e   h          p                   s  v   d
               e                                                       n
                                                                       s



        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** * *. .:   *  : *    :*.   .   **       .*  *   *   :      **:  .:*:  *.  * :
SFPKIHLqEDIiNRCQQFVGPLTVNEKRRLKLIMPARFYPthTKYLPLDKGIKPYYPDqVVNHYFQTRHYLHTLWKAGIL
       h   ad  e       a                ns   f  h        ehi     ka
           sh                            r
           v



       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
     :  :*   :    **           .   . :       *:  ..  *. :  :  :     :  :  :
YKRETTRSASFCGSPYSWEQELqHGRLVikTSQRHGDEsFCSQpSGILSRSSVGPCIRSQlKQSRLGLQPHQGPLAsSQp
    s                 h ---dtqa       pi pksa  p      sg    f         r rs  tg s
                           -sn         v f             r              q     n
                            -



       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
       .      .      ..                 *.
GRSGSIRARvHpsTRRcFGVEPSGSGHIdhSvnnSSSCLHQSAVRKAAYSHLSTSKR--QSSSGHAVEfHclPPSSAgSQ
      wp a sp   ys         vgyiassa h  r   d tt ht f        p   rt dl sfssnatrp
                 l         t nf g          a                    n     n     e




       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
          . *    **  : ::.     .  *** .  :  *    :*  :*. :::* *.*:*  : .*** *
SQGsVfSCWWLQFRNskPCSeYCLSHLVNLrEDWGPCdEHGEHHIRIPRTPARVTGGVFLVDKNPHNTAESRLVVDFSQF
g  p sp        tq   k  i  ii  ld     ad       t k                   t
               i    n                tn
                    q                v
                                     f
                                     g

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
.    *.*..** ** *****:  . *.*:* *.**** *:****: **.*:: *  *:  :  *:    .
SRGiTRVSWPKFAVPNLQSLTNLLSSNLSWLSLDVSAAFYHIPLHPA-AMPHLLIGSSGLSRYVARLSSNSRInNNQyGT
   ts                                                 v ta  pg          nh h h n
   l
   v
   s


       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  .:*   :   * .::**   :* : *:   *  :. **   *:. **  ::: ..   *      *. :.: * :* :
mQNLHDSCSRQLYVSLMLLYKTYGwKLHLYSHPIvLGFRKIPMGVGLSPFLlAQFTSAICSVVRRAFPHCLAFSYmDDVV
l d  e    h     l   q   r         i         l      m                       v  i
                                                                           i  l




       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  :               *: : * ::.  *  ..**:*    : *  *  :*:    .    *:   * :   **. **
LGAKSVQHrEsLYTAVTNFLLSLGIHLNPNKTKRWGYSLNFMGYiIGSWGTLPQDHIVQKIKhCFRKLPVNRPIDWKVCQ
    ta  l a f       f                  h    v     s   e  i  l n      id  v
                                                              c
                                                              q
                                                              d


       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
: .:*.:  . :** ***  ***: :::. :   * .  .:*   *     ..*:*   *** **  * * . . *
RIVGLLGFAAPFTQCGYPALMPLYACIQAKQAFTFSPTYKAFLSkQYMNLYPVARQRPGLCQVFADATPTGWGLAIGHQR
                             r             nq  ld        s
                                           rt




       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
: . :      * .                                  ::    *.:*  *      * **    **
MRGTFVAPLPIHTAELLAACFARSRSGAKLIGTDNSVVLSRKYTSFPWLLGCTANWILRGTSFVYVPSALNPADDPSRGR
                            n                       a
                            t




       810       820       830       840
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....
     *                   * ** . .       *
LGLsRPLLRLPfqPTTGRTSLYAVSPSVPSHLPvRVHFASPLHVAWRPP
  iy       yr          d         d            k