HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for nucleotide sequence S of genotype G

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**** **  *   ******** * ** *** ****** **  * ***** **    **** *** ***** * ** ****
ATGGAGAACATCACATCAGGATTCCTaGGACCCCTGCTCGTGTTACAGGCGGGGTTTTTCTTGTTGACAAgAATCCTCAC
          ca         c    c              a c         a                a



        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*** **  *** ********************** *** *********** *    * * ***** ***** ********
AATACCGCAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGGGAgtgcCCGTGTGTCcTGGCCtAAATTCGC
      a                                           a acaa         t     a
                                                  r t r


       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
********************  ** ** *** *******  * ********* **************   ***** ****
AGTCCCCAACCTCCAATCACTCACCAAtCTCCTGTCCTCCAAcTTGTCCTGGcTATCGCTGGATGTGTCTGCGGCGTTTT
                     a  t  c   t          t         t               t
                           y              y         a
                                                    y

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
***** ******  * *************** ********* ******* ****** ***** ** **************
ATCATaTTCCTCTTCATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTTGTTGGTTCTTCTGGAcTATCAAGGTATGTTGCCCGTTTG
     c                                           w      t     g
                                                              m


       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*** **  ** ********** ******** ** *** * **** *********   ***********************
TCCTCTgATTCCAGGATCCTCGACCACCAGTACGGGACCcTGCAaAACCTGCACGACTCCTGCTCAAGGCAACTCTATGT
      a   t                   c      a a    g



       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*****  **********  **** *  **   **************************** **  ********* ****
ATCCCTCATGTTGCTGTACaAAACCTTCGGACGGAAATTGCACCTGTATTCCCATCCCATCATCTTGGGCTTTCGCAAAA
       c          tc    t       a                            r  y



       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* ** *****  **** ***** ********* ** **** ** ** ** ***************** ** *********
TACCTATGGGAGTGGGCCTCAGtCCGTTTCTCtTGGCTCAGTTTACTAGTGCCATTTGTTCAGTGGTTCGTAGGGCTTTC
           t          c         a       a        c
           c                    c


       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** ** *** ***** * *  **  * ****** * ** ** *** ***   *** *** ** ** **  ** *** * *
CCCCACTGTCTGGCTTTCAGcTATaTgGATGATGTGGTATTGGGGGCCAAaTCTGTACAACATCTTGAGTCCCTTTATAC
  a      t          t   g t      a t  t  r   a    g           c     ag  a   t
                        r a      r r
                          r

       650       660       670       680
....:....|....:....|....:....|....:....|.
*** * ******* ****   ** ** ** ******
CGCTGTTACCAATTTTCTTtTGTCTTTGGGTATACATcTAA
      a            gct  y            t g