Dataset for nucleotide sequence Genomes of genotype E
[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]
10 20 30 40 50 60 70 80 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * ** * * ******* ** * * TTCCACAACATTCCACCAAGCTCTGCAGGATCCCAGAGTAAGAGGCCTGTATttTCCTGCTGGTGGCTCCAGTTCCGGAA at a g t a a a aa a-----a----------c-- t -g gc-gaat -cc c 90 100 110 120 130 140 150 160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * ** *** * * * ** *** * * * * * *** * * * ** * CAGTGAACCCTGTTCCGACTACTGCCTCACTCATCTCGTCAATCTTCTCGAGGATTGGGGACCcTGCACCGAACATGGAA a g t t a t g g y c a 170 180 190 200 210 220 230 240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** *** **** ** ** ******* ** *** * * * * ** ** *** *** ** AGCATCACATCAGGATTCCTAGGACCCCTGCTCGTGTTACAGGCGGGGTTTTTCTTGTTGACAAAAATCCTCACAATACC ga t g a a ca a c t 250 260 270 280 290 300 310 320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ** **** ************ * ** ****** * * * ***** ** ** * * ** GCAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGGGAGCTCCCGTGTGTCTTGGCCAAAATTCGCAGTCCC a a g a tt g t a c 330 340 350 360 370 380 390 400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * ***** ** * *** ** ** * ** * * **** * *** ** ** * CAAcCTCCAaTCACTCACCAACCTCTTGTCCTCCAATTTGTCCTGGCTATCGCTGGATGTGTCTGCGGCGTTTTATCATC t g t g cc g t t t t a 410 420 430 440 450 460 470 480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** ***** * ** * ***** ******* * ** **** ** ** ** * ** **** ** *** * * TTCCTCTTCATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTTGTTGGTTCTTCTGGACTATCAAGGTATGTTGCCCGTTTGTCCTCT c c a 490 500 510 520 530 540 550 560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** **** * * * * ** * * * *** ** * ** * **** **** AATTCCAGGATCATCAACCACCAGTACGGGACCCTGCCGAACCTGCACGACTCTTGCTCAAGGAACCTCTATGTTTCCCT c cc c ta c g ca 570 580 590 600 610 620 630 640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** ** * * ** * *** * * ** ******** ** ** ******** * ***** **** CATGTTGCTGTTCAAAACCTTCGGACGGAAATTGCACTTGTATTCCCATCCCATCATCATGGGCTTTCGGAAAATTCCTA c t g aa 650 660 670 680 690 700 710 720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **** ******* ** ***** ** ** ** ** ***** ** * ** ** ******** ** ******* ** TGGGAGTGGGCCTCAGCCCGTTTCTCCTGGCTCAGTTTACTAGTGCCATTTGTTCAGTGGTTCGCCGGGCTTTCCCCCAC g t ta t y 730 740 750 760 770 780 790 800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * ***** * ** ************* **** * * ** * ** ** * * * * *** ** TGTCTGGCTTTCAGTTATATGGATGATGTGGTATTGGGGGCCAAGTCTGTACAACATCTTGAGTCCCTTTATACCTCTGT t t g gaa cg c c g tg a 810 820 830 840 850 860 870 880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ***** ** * * **** ** * * ** * ** ***** ** * * * **** TACCAATTTTCTTTTGTCTTTGGGTATACATTTAAATcCCAACAAAACAAAAAGATGGGGATATTCCCTaaATTTCATGG g t c c g t t ct t gc g t tt gc c t k g a t g c 890 900 910 920 930 940 950 960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * *** *** ** * * ** ** * ** ** ** *** * ***** * ** ** ** GTTATGTAATTGGaAGTTGGGGgTCATTACCACAgGAaCACATCAgAaTGAAAATCAAAGACTGTTTTAGAAAACTCCCT c ca c t a c g g a t tca tca c g t cc g c t a c c c c c ca a 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * * ** ***** * * * * * ** ** * * ** * ** ** ** ** ***** ** GTTAAcCGGCCTATTGATTGGAAAGTATGTCAAaGAATTGTGGGTCTtTTGGGCTTTGCTGCCCCTTTTACACAATGTGG c ta a c c gc gc c g a t c g g a c 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** ** **** ** * * ** * ***** ** ** * * ** * * * ** aTATCCTGCTTTAATGCCTCTgTATGCGTGTATTCAATCTAAGCAGGCTTTCACTTTCTCGCCAACTTACAAGGCCTTTC g g gt a a a c cc ggac g a t tg t a g a ct c a c r c g 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** ***** ***** * * * *** * * ******** ***** ** ***** *** TGTGTAAACAATAccTGAACCTTTACCCCGTTGCCCGGCAACGGCCaGGTCTGTGCCAAGTGTTTGCTGATGCAACCCCC a a ccc g taa gc t tac a c t 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** ********* * * * * * ** * ** *** * * ** * * *** * ** **** ACTGGCTGGGGCTTGGCCATAGGCCATCAGCGCaTGCGtGGAACCTTTGTGGCTCCTCTGCCGATCCATACTGCGGAACT t t g at a c a c c a a a tg c g t 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** ***** *** **** * **** ** * ** ** * ** ** ** ** ** ** * ** CCTAGCCGCTTGTTTTGCTCGCAGCAGGTCTGGAGCgAAACTTATCGGGACaGATAATTCTGTCGTTCTCTCcCGGAAAT t g a c c g accc c a a t c c t c a a g t g t c c 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * ** ****** **** ** * **** ** *** * ** *********** * * *** * *** ATACATCaTTTCCATGGCTGCTAGGCTGTGCTGCCAACTGGATCCTGCGAGGGACGTCCTTTGTCTACGTCCCGTCAGCG c c a a aa t g g t t 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * * ****** ** * * ** * * ** * *** * ** ** * ** * * ** CTGAATCCTGCGGACGACCCgTCTCGGGGTCGCTTGGGGaTCTaTCGTCCCCTTCTCCGTCTGCCGTTCCaGCCGACCAC c c c tc g t cc t a a ga at a a g c c t 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * ** * * * *** * * ***** * ** ** * * ** *** * * *** * * ****** GGGGCGCACCTCTCTTTACGCGGTCTCCCCGTCTGTgCCTTCTCATCTGCCGGaCCGTGTGCACTTCGCTTCACCTCTGC g a tg a gc c t t a g c 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **** ***** ** **** * * * *** ** * ** ***** * **** ACGTCGCATGGAGACCACCGTGAACGCCCAC------CAAaTcTTGCCCAAGGTCTTACATAAGAGGACTCTTGGACTCT a c a t t aggcga t c t t t g 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******** * ******** * **** * ** * ** ** * ** ***** * ******** CtGCAATGTCAACGACCGACCTTGAGGCATACTTCAAAGACTGTTTGTTTAAAGACTGGGAGGAGTtGGGGGAGGAGAtT ag t g a g g a c cc c c g a 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * *** **** ******** ***** * ** ** * ***** ** **** AGaTTAAaGgTCTTTGTACTAGGAGGCTGTAGGCATAAATTGGTCTGCGCACCAGCACCATGCAACTTTTTCACCTCTGC g c ct a g ct c g t t g 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ** * ** * *** * * ***** * * * ** ********* **** ** ***** * ** * CTAATCATCTCTTGTTCATGTCCTACTGTTCAAGCCTCCAAGCTGTGCCTTGGGTGGCTTTgGGgCATGGACATTGACCC c t c a a c t r r y 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** *** ***** * * * ** ******** ** ** * ** * * * * TTATAAAGAATTTGGAGCTaCTGTGGAGTTACTCTCGTTTTTGCCTTCTGACTTCTTTCCTTCAGTAAGAGATCTTCTAG gtgc c t gggc t t a ag ca t ag t a aa c 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** * * ** * * **** ATACCGCCTCaGCTCTGTATCGGGATGCCTTAGAATCTCCTGAGCATTGTTCACCtCACCAcACtGCACTCAGGCAAGCC t ta t t c t g g t a gtca cgyg t ct g ta tt ac c c c a c a 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * *** * * * ** **** ** ** ** * * * * ** * ATTCTTTGCTGGGGgGAacTAATGAcTCTAGCTACCTGGGTGGGtGtAAATTTGGAAGATCCAGCATCCAGGGACCTAGT g a g t a ct t taca gc a gact c ac c c act c t a ttat t tg g t g t a a a g a a g 2170 2180 2190 2200 2210 2220 2230 2240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ***** ** * * * ** * * ** ** ** * ** ** AGTCAGTTATGTCAATACTAATATGGGCCTAAAGTTCAGGCAATTATTGTGGTTTCACATTTCTTGTCTCACTTTTGGAA g tgac t cga cccg t cat t a t a c t c ca t tg c g t g a g 2250 2260 2270 2280 2290 2300 2310 2320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * ** ** ** * ** * *** * ******* * ** * ** ******** GAGAAACcGTCaTAGAGTATTTGGTGTCTTTTGGAGTGTGGATTCGCACTCCTCCAGCTTATAGACCACCAAATGCCCCT c tgtt tg t tc a c aatc g c g a c a at tc c c 2330 2340 2350 2360 2370 2380 2390 2400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * * *** ** * ***** ***** *** * * * ** * ******* ** ATCTTATCAACACTTCCGGAGAaTACTGTTGTTAGACGAAGAG------GCAGGTCCCCTAGAAGAAGAACTCCCTCGCC c t a c g a c - c c a t t 2410 2420 2430 2440 2450 2460 2470 2480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** * ** *** ** *** * * **** *** * * * * * ** ** * * * TCGCAGACGAAGATCTCAATCGCCGCGTCGCAGAAGATCTCAATCTCCAGCTTCCCAATGTTAGTATTCCTTGGACTCAC c cc tg g aagc a g t 2490 2500 2510 2520 2530 2540 2550 2560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** **** * ** * ** *** * * ** ** * * ** * * ** ** AAGGTGGGAAATTTTACGGGGCTTTAcTCTTCTACTATACCTGTCTTTAATCCTAACTGGAAAACTCCATCTTTTCCTGA c a a g t a c t t a t cgt c t t c aa c c 2570 2580 2590 2600 2610 2620 2630 2640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** * * ** ** * * * ** * ** * ** ** ** * ** * * *** * * TATTCATTTGCACCAGGACATTATTAACAAATGTGAACAATTTGTAGGTCCTCTAACAGTAAATGAAAAACGAAGATTAA c a a t c g t g g g c ct t t a gc gc g 2650 2660 2670 2680 2690 2700 2710 2720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ***** * * ** * *** ** ** ** * ** ** ** * ** * ** ** * AcTTAGTcATGCCTGCTAGATTTTTTCCCATCTCTACgAAATATTTgCCCCTAGAGAAAGGTATAAAACCTTATTATCCA tc a t t ag a a at g t g g t c c c c a t t t t c t 2730 2740 2750 2760 2770 2780 2790 2800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ******* ***** ** * ** ***** * * * *** * * ** * ** **** * * GAtAATGTAGTTAATCATTACTTCCAAACCAGACACTATTTACATACCCTATGGAAGGCGGGCATCTTATATAAAAGaGA c c g t tc t g c tt t g tg gc g g g a 2810 2820 2830 2840 2850 2860 2870 2880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** **** ** * ** * ****** * ** * ***** AACTACaCGTAGCGCCTCATTTTgTGGGTCACCTTATTCTTGGGAACAAGAGCTACATCATGGGGCTTTCTTGGACGGTC gt c a t t c tg t a c c a g a g g ac t 2890 2900 2910 2920 2930 2940 2950 2960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * *** * * ** * ***** ** ******** **** ** CCTCTCGAATG---GGGGAAGAATCATTCCACCACCAATCCTCTGGGATTTTTTCCCGACCACCAGTTGGATCCAGCATT a a t g t a t t g a c 2970 2980 2990 3000 3010 3020 3030 3040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** ** * ******** ***** *** *** * * ********** CAGAGCAAACACCAGAAATCCAGATTGGGACCACAATCCCAACAAAGACCACTGGACaGAAGCCAACAAGGTAGGAGTGG ca g t cac tat c t tag cc c 3050 3060 3070 3080 3090 3100 3110 3120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** * * ** * * * ** ** * * ** * * * * ** GAGCATTCGGGCCgGGGTTCACTCCCCCACACGGAGGCCTTTTGGGGTGGAGCCCTCAGGCTCAAGGCATGCTAAAAACA t t t c t g t t c a c t g tagcc tg a c c t 3130 3140 3150 3160 3170 3180 3190 3200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * ** * ** * ***** * TTGCCAGCAGATCCGCCTCCTGCCTCCACCAATCGGCAGTCAGGAAGGCAGCCTACCCCAATCACTCCACCTTTGAGAGA g a at a t tg a a c c c g 3210 3220 ....:....|....:....|....:.. * * * * ** * CACTCATCCTCAGGCCATGCAGTGGAA g c t g a a c c |