HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for nucleotide sequence S of genotype RF

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* *   *  *   * **      **    *****    **       * ***  *    ** **           * *
ATGGAGAACAtCaCATCAGGAtTCCTAGGACCCCTGCTCGTGTTACAGGCGGGGTTTTTCTTGTTGACAAgAATCCTCAC
       g  cag        c    caa      t    c                    c        a
           tt


        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
          * *              *  ***   *  ** **   * *            * * ** **  * **  *
AATACCgCAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGGGAaCtaCCgtGTGTCtTGGCCAAAATTCGC
      aa                  t           g           aggtac  ac     c     t     t
                                                    tacg         g
                                                      g

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*   *  * *  *   ***   *     *   *  * *     **    ** ** *    *   *   *****   * *
AGTCCCcAAcCTCCAaTCACTCACCAACCTccTGTCCTCCAAcTTGTCCTGGtTATCGCTGGATGTGTCTGCGGCGTTTT
      a  t     g           tt gt       ag t         c     t       a



       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*      **    * **  *        ***** *   *     *  *    ***         **  *  *  *   *
ATCATaTTCCTCTtCATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTTGTTGGTTCTTCTGGACTAtCAAGGTATGTTGCCCGTTTG
     c       g                           a         g    t  c  g              g
                                                              c


       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*                    *           **  * ***       **        **           * *  *
TCCTCTAaTTCCAGGAtCtTCaACcACCAGcACgGGACCcTGCAgaACCTGCACgACTCCTGCTCAAGGaAcCTCTATGT
      gc        a aa g  a  a  t tc   a a   cag        a t at     g aac a    t
      c           c     t        a   t                    t
                  g     g

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
    **   * ** * *    **      *   * **  ** * *******  * *** *     * ** ***   *
aTCCCTCcTGTTGCTGTACAAAACCTtCGGAcGGAAAtTGCACcTGTATTCCCATCCCATCATCcTGGGCTTTCGgAAAA
t      a     t   t c      at   t     c     t                 g  t          c  g
       t                                                        a


       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   * ** *     ** *   * ** ** **       ** **        *  * * ***        *   *   ***
TtCCTATGGGAGTGGGCCTCAGcCCGTTTCTCtTGGCTCAGTTTACTAGTGCCATTTGTTCAGTGGTTCGTAGGGCTTTC
a                    t         c          c     c                    c
                                a


       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** *   *  ***   *    *** * **  **   *    * *  *             ** *  **     * *
CCCCACTGTtTGGCTTTCAGTTATATGGATGATGTGGTaTTGGGGGCCAAGTCTGTACAgCATCTTGAGTCCCTTTtTaC
     t   c       t  c   g        a    tc       g  aa    gtca  c g   ag      a g
                                 c


       650       660       670       680
....:....|....:....|....:....|....:....|.
            ** * *    *    ***    *   *
CGCTGTTACCAATTTTCTTTTGTCTTTGGGTATACATTTaA
t  a                    c    c     ac g