HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for nucleotide sequence PreS2 of genotype RF

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
         *   *                             *                      * ** ***  *
ATGCAGTGGAAcTCCACaACcTTCCACCAAaCTCTgCaAGATCCCAGaGTgAGaGgcCTgTAtTTcCCTGCTGGTGGCTC
g aa       t  t gcgat  t tt   g    t tg  c  a  g  c ag ct  a  cc t
              a  t  a              a        g     a        t
                    g

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
    *              *    **  *                 *        *          ** **  * **
CAGTTCaGGAACAGTaAaCCCTGtTCcGAcTACTGcCTCTccCATATCGTCAATCTTcTCGAgGAtTGGGGACCCTGcgC
a     c ag t ccg g     c  aa ac t  ta  aga tcc ta    c  cagt  a  c     g  t  taa
               c          t             tt                    c
                                        a

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  *  ***   *  *   ****  *   **    *****    **       * *** **    ** ***
cGAACATGGAGAACATCaCATCAGGAtTCCTAGGACCCCTGCTCGTGTTACAGGCGGGGTTTTTCTTGTTGACAAgAATC
t  ct       g  cag        c     ac      t    c                    c        a
a               tt


       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* *    *  *    * *              *  ***   *  ** **   * *           ** * ** ** **
CTCACAATACCgCAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGGGAaCtaCCGtGTGTCtTGGCCAAAA
           aa                  t           g           aggtac  ac     c     t
                                                         tac          g
                                                           g

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**  ***  **  * *  *   ****  * *   *  *** * *     **   *** ****    *   *   *****
TTCGCAGTCCCcAAcCTCCAaTCACTCACCAACCTccTGTCCTCCAAcTTGTCCTGGTTATCGCTGGATGTGTCTGCGGC
  t        a  t     g            t gt       ag t         c     t       a



       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  * * *  *   ***   * **  *        ***** ** ***    *  *    *** *     * **  *  *
GTTTTATCATaTTCCTCTtCATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTTGTTGGTTCTTCTGGACTATCAAGGTATGTTGCCC
          c       g                           a         g    t  c  c
                                                                   g


       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*   * *                    *  *        **  * ***      ***        **           *
GTTTGTCCTCTAaTTCCAGGAtCtTCAACcACCAGCACgGGACCcTGCAgaACCTGCACgACTCCTGCTCAAGGaACCTC
  g        gc        a aa g  a  a  t  c   t a   cag        a t at     g aac a
           c           c     t        a   a
                       g

       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*  *    **** ** ** ***    **      *   * **  ** * *******  * *** *   * * ** ***
TATGTaTCCCTCcTGTTGCTGTACAAAACCTtCGGAcGGAAAtTGCACcTGTATTCCCATCCCATCATCcTGGGCTTTCG
t   t      a     t   t c      at   t     c     t                 g  t
            t                                                        a


       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*      **** *     ** *   * ** *****    ** ** **   *    *  * * ***  *     *   *
gAAAATtCCTATGGGAGTGGGCCTCAGcCCGTTTCTCtTGGCTCAGTTTACTAGTGCCATTTGTTCAGTGGTTCGTAGGG
c  g  a                    t         c          c     c                    c
                                     a


       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  ***** *   *  ***   *    *** * **  ** * *    ***  *             ** *  **     *
CTTTCCCCCACTGTtTGGCTTTCAGTTATATGGATGATGTGGTaTTGGGGGCCAAGTCTGTACAgCATCTTGAGTCCCTT
          t   c       t  c            a    tc       g  aa    gtca  c g   ag
                                      c


       810       820       830       840
....:....|....:....|....:....|....:....|....:.
* *              **** *    *    ***    **  * *
TtTaCCGCTGTTACCAATTTTCTTTTGTCTTTGGGTATACATTTaA
a g  t  a                    c    c      c g