HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for nucleotide sequence S of genotype H

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*** *** ****** * ****  ** * * * ** ** *********** ***** **  * ***** **** *** **
ATGGAGAACATCACATCAGGACTCCTAGGACCCCTTCTCGTGTTACAGGCGGTGTGTTTCTTGTTGACAAAAATCCTCAC
                                     c           g     t  c  c     t        g
                                                       a

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*** **   *** ******* ************** ** ** ***** **   * ** * ************** ** **
AATACCAcAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGGTACCACCCGGGTGTCCTGGCCAAAATTCGC
      cag                             g           a   t    a              g


       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
********* *********** ** ** *** *************************** *** ****************
AGTCCCCAATCTCCAATCACTTACCAACCTCCTGTCCTCCAACTTGTCCTGGCTATCGTTGGATGTGTCTGCGGCGTTTT
         c              a  t   t                           c


       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* ***** ******** ** ******* ****   *    **   *    * ************************* **
ATCATCTTCCTCTTCATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTTGTTGGTTCTTCTGGACTATCAAGGTATGTTGCCCGTGTG
                           g         ct    ct                                a


       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
****** ***********  * ** ******* *** ** ****  ********  * * ****** ***  *******
TCCTCTACTTCCAGGATCtACAACCACCAGCACGGGACCCTGCAAAACCTGCACCACTCTTGCTCAAGGAACCTCTATGT
      g           at g  t           t        g        g    y      c
                  cc

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  ***** ** ** ***   *****  ****  **** ***** **** ********* ** ** ********    **
TTCCCTCCTGCTGCTGTACCAAACCTTCGGACGGAAATTGCACCTGTATTCCCATCCCATCATCTTGGGCTTTCGGAAAA
a      t     t     a     c     t                             g           t t
       a

       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* ********  ********** ********  **************** **  **** ******** ** *** *****
TACCTATGGGAGTGGGCCTCAGCCCGTTTCTCTTGGCTCAGTTTACTAGTGCAATTTGtTCAGTGGTGCGTAGGGCTTTC
           t                    a                c  c     c
           c

       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
***** **  **** **  * *** ******** ************* ** ****     ** *  * * ** *******
CCCCACTGTCTGGCTTTTAGTTATATGGATGATtTGGTATTGGGGGCCAAATCTGTGCAGCATCTTGAGTCCCTTTATAC
                 cg c   g        c                      ag a  c cg   g  a
                                 g                         r

       650       660       670       680
....:....|....:....|....:....|....:....|.
*** * ********  * ** *** **** ** ***** *
CGCTGTTACCAATTTTTTGTTATCTGTGGGCATCCATTTgA
               gc    g           a     a