HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for nucleotide sequence PreC of genotype H

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*    ** ** ************ *** **  *** ******* ***********************************
ATGCAACTTTTTCACCTCTGCCTAATCATCTTTTGTTCATGTCCCACTGTTCAAGCCTCCAAGCTGTGCCTTGGGTGGCT
t ttwc  c  c            g   g  cw   w       t
    t                          y
    c

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
***** ****** ** **** ** ******************** ***** ***  * *** *****  *** **** **
TTGGGGCATGGACATTGACCCTTATAAAGAATTTGGAGCTTCTGTGGAGTTACTCTCATTTTTGCCTTCTGACTTCTTCC
     a      g  c    t  t                    c     k   gy m   c     aa   t    a



       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** ** ** **** ** * ********** ********  * **** *********** ** ** ****** ****   *
CGTCTGTCCGGGACCTACTCGACACCGCTTCAGCCCTCTACCGAGATGCCTTAGAATCACCcGAACATTGCACCCCCAAC
  c  a  g    t  g y          a        ct a    g           t  a  t      t    tcg
                                                             t


       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*  ** **  ********* * **  ******* * *** * * *   ** * *  ********** ******** * **
CAcACTGCTCTCAGGCAAGCTATTTTGTGCTGGGGTGAGTTGATGACcTTGGCTTCCTGGGTGGGCAATAATTTAGAGGA
rt  a  ca         t g  cc       c g   g a c gaa  c g ga          c        c t
  y                                           tt                           a


       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**  *   * *** **** ** *************    * * ** ** ****** *****   **  * **** *** *
TCCTGCAGCaAGAGATCTAGTAGTTAATTATGTCAATACTAAcATGGGcCTAAAAATTAGACAATTATTATGGTTTCAcA
  ag ggt c   a    t  g             gcga c t  a  t      c     atg  cc g    y   t
     ac  t                                                    g   g  r


       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**** * *** ** ***** * ***   ***  ******** ***** ********* ****** ** *****      *
TTTCCTGCCTTACATTTGGAAGAGAAACTGTgCTTGAGTATTTGGTGTCTTTTGGAGTGTGGATtCGCACTCCACCTGCT
    t s   a  g     g a   tgt   ta        c     y         g      c  t     tgyacg
                                                                         g t


       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** *********************** ** **  **** ***  *  **** ******  *********** ****** *
TAtAGACCACCAAATGCCCCTATCCTATCAACACTTCCGGAGACTACTGTTGTTAGACAACGAGGCAGGGCCCCTAGAAG
  c                       r  c  ga    t   tg tg    a      cc           t      g
                          g


       570       580       590       600       610       620       630
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....
****************** ************ **** ********* ********* ***** * ***** * ******
AAGAACTCCCTCGCCTCGCAGACGAAGATCTCAATCaCCGCGTCGCAGAAGATCTCAATCTCCAGCTTCCCAATGTTAG
                  y            a    t         c         c     g t     a r
                                    g                                   g