Dataset for nucleotide sequence Genomes of genotype H
[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]
| 10 20 30 40 50 60 70 80 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * ** *** *** ** ******* ***** **** * *********************** *** CTCAACACAGTTCCACCAAGCACTGTTGGATCCGAGAGTAAGGGGtCTGTATTTTCCTGCTGGTGGCTCCAGTTCAGAAA nnnnct ag ca aca tc a a ct g g g c a c 90 100 110 120 130 140 150 160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **** ******* ********** ******* **** **** *********************** * *********** CACAGAACCCTGCTCCGACTATTGCCTCTCTCACATCATCAATCTTCTCGAAGACTGGGGACCCTGcTATGAACATGGAG a tg t g g c t c 170 180 190 200 210 220 230 240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ********************* ********* *********** ***** ***** ********** *** ********* AACATCACATCAGGACTCCTAGGACCCCTTCTCGTGTTACAGGCGGTGTGTTTCTTGTTGACAAAAATCCTCACAATACC a c g t c g g 250 260 270 280 290 300 310 320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * *************************************** ************************************** AcAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGGTACCACCCGGGTGTCCTGGCCAAAATTCGCAGTCCC a a 330 340 350 360 370 380 390 400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***************************************************** ************************** CAATCTCCAATCACTTACCAACCTCCTGTCCTCCAACTTGTCCTGGCTATCGTTGGATGTGTCTGCGGCGTTTTATCATC c 410 420 430 440 450 460 470 480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ********************* ********************************************************** TTCCTCTTCATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTTGTTGGTTCTTCTGGACTATCAAGGTATGTTGCCCGTGTGTCCTCT g 490 500 510 520 530 540 550 560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ************ **************** ******** ************* ********** ******** ****** ACTTCCAGGATCTACAACCACCAGCACGGGACCCTGCAAAACCTGCACCACTCTTGCTCAAGGAACCTCTATGTTTCCCT ac t g y c c w 570 580 590 600 610 620 630 640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** **** ***************************************** ************************ CCTGCTGCTGTACCAAACCTTCGGACGGAAATTGCACCTGTATTCCCATCCCATCATCTTGGGCTTTCGGAAAATACCTA t t t ta g 650 660 670 680 690 700 710 720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** ******************** **************** ** ***** *************************** TGGGAGTGGGCCTCAGCCCGTTTCTCTTGGCTCAGTTTACTAGTGCAATTTGtTCAGTGGTGCGTAGGGCTTTCCCCCAC t a c c c c 730 740 750 760 770 780 790 800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ******* * *** ******** ********************** ************ **************** TGTCTGGCTTTTAGTTATATGGATGATtTGGTATTGGGGGCCAAATCTGTGCAGCATCTTGAGTCCCTTTATACCGCTGT t cg c g c a g g 810 820 830 840 850 860 870 880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ********************************* *** ************** ******* *** ** * ********** TACCAATTTTTTGTTATCTGTGGGCATCCATTTgAACACAGCTAAAACAAAATGGTGGGGTTATtCCtTaCACTTTATGG a g a c a c t r w 890 900 910 920 930 940 950 960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** ******** ******** *********************** ********* * ****** ********** GTTATAtaATTGGGAGTTGGGGGACcTTGCCTCAGGAACATATTGTGCATAAAATCAAAGATTGCTTTCGCAAACTTCCC ggc c a a a g y t s g 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** *** **** *********** ** ******** ******************************** *********** GTgAATAGACCCATTGATTGGAAGGTTTGTCAACGcATTGTGGGTCTTTTGGGCTTTGCAGCCCCTTTTACTCAATGTGG t c t a c a c r a 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ***************** ******** ** * ***** ************************************* TTATCCTGCTCTCATGCCCTTGTATGCCTGTATTACCGCTAAGCAGGCTTTTGTTTTCTCGCCAACTTACAAGGCCTTTC c a c cr t a c 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * ****** *** ************************ ** ********************************* TCTGTAAACAATACaTGAACCTTTACCCCGTTGCTCGGCAACGGCCAGGCCTTTGCCAAGTGTTTGCTGACGCAACCCCC gc c c c c a g a 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***************** *************** ******* ******* ************ *********** ***** ACTGGCTGGGGCTTGGCGATTGGCCATCAGCGCATGCGCGGAACCTTTGTGGCTCCTCTGCCGATCCATACTGCGGAACT a c c a c a 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ** ** *************** ************** ******* ** ******** ******** ********** CCTAGCaGCtTGTTTCGCTCGCAGCaGGTCTGGAGCGGACaTTATCGGCACTGACAACTCcGTTGTCCTTTCTCGGAAGT c c c c g a c t g r 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******************** * ** ************************************** *************** ACACCTCCTTCCCATGGCTGCTAGGcTGTGCTGCCAACTGGATCCTGCGCGGGACGTCCTTTGTCTACGTCCCGTCGGCG a c t t a 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ************************ ***** ********* ****** *********** ********** * ** CTGAATCCTGCGGACGACCCCTCTCGTGGTCGCTTGGGGCTCTgCCGCCCtCTTCTCCGCCTgcCGTTCCGGCCGACGAC a g tc a c at at a tg c 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ************************************* ***** ***** ************** *********** GGGTCGCACCTCTCTTTACGCGGACTCCCCGCCTGTGCCTTCTCATCTGCCGGCCCGTGTGCACTTCGCTTCACCTCTGC a g t a a g 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** ********** ************ * * ********** **** **** ** ******** ** * ACGTCGCATGGAGACCACCGTGAACGCCCCTtgGAaCTTGCCAACAACCTTACATAAGAGGACTCTTGGACTTTC---GC a m a caa g c gt a a t c -atg-a c yr t ct 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ********************* ******** ******** ******************** ********* **** CCCGGTCAACGACCTGGATTGAGGAATACATCAAAGACTGTGTATTTAAGGACTGGGAGGAGTCGGGGGAGGAGTTGAGG a a c g g a cc 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **** * * * **** **************************** ***** ****** ****** ************ TTAAaGGTCTTTGTATTAGGAGGCTGTAGGCATAAATTGGTCTGTTCACCAGCACCATGCAACTTTTTCACCTCTGCCTA t a t a c yk c ttc c g 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ****** *** ************************************************ ****** ** **** ** ATCATCTTTTGTTCATGTCCCACTGTTCAAGCCTCCAAGCTGTGCCTTGGGTGGCTTTGGGGCATGGACATTGACCCTTA g cw w a g c t t 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******************** ********* ***** ***** *** **** **** ***** **** ** ******* TAAAGAATTTGGAGCTTCTGTGGAGTTACTCTCATTTTTGCCTTCTGACTTCTTCCCGTCTGTCCGGGACCTACTCGACA c gy c aa t a c g t g 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ************** * **** *********** ** ** ****** **** *** ***** ********* * ** CCGCTTCAGCCCTCTACCGAGATGCCTTAGAATCACCcGAACATTGCACCCCCAACCAcACTGCTCTCAGGCAAGCTATT ct a g t a t t tcg t ca t g t 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******* * *** * * * ** * * ******************* * **** * ** ******** ** ** TTGTGCTGGGGTGAGTTGATGACcTTGGCTTCCTGGGTGGGCAATAATTTAGAGGATCCTGCAGCaAGAGATCTAGTAGT cc c g g a c gaa c g ga c t ag gg c t g tt a t 2170 2180 2190 2200 2210 2220 2230 2240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ************ ** * ** ** ************* *** * ******** ***** ******** ***** **** TAATTATGTCAATACTAAcATGGGcCTAAAAATTAGACAATTATTATGGTTTCAcATTTCcTGCCTTACATTTGGAAGAG cg c t a t g cc g t t g g g 2250 2260 2270 2280 2290 2300 2310 2320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * *** ******** ********************** ** ***** * ** *** ********************* AAACTGTgCTTGAGTATTTGGTGTCTTTTGGAGTGTGGATtCGCACTCCACCTGCTTAtAGACCACCAAATGCCCCTATC tgt ta c c t g y g c 2330 2340 2350 2360 2370 2380 2390 2400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** ** *********** **** ****** ************ ****** ************************* CTATCAACACTTCCGGAGACTACTGTTGTTAGACAACGAGGCAGGGCCCCTAGAAGAAGAACTCCCTCGCCTCGCAGACG g c ga tg a c t g 2410 2420 2430 2440 2450 2460 2470 2480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******* **** ********* ********* ******* ***** * ********* ** ****************** AAGATCTCAATCaCCGCGTCGCAGAAGATCTCAATCTCCAGCTTCCCAATGTTAGTATTCCTTGGACTCATAAGGTGGGA a t c c t a g c g g 2490 2500 2510 2520 2530 2540 2550 2560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ************************ ********* ******** *** ******* ********* ******* * AACTTTACCGGTCTTTACTCCTCTACTaTACCTGTTTTCAATCCTGACTGGTTAACTCCTTCTTTTCCTGACATTCACTT t gc t t c c a tc r 2570 2580 2590 2600 2610 2620 2630 2640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ********* ******* ******** ******** ************ ****** **** ******** * **** GCATCAAGATcTGATACAAAAATGTGAACAATTTGTaGGCCCACTCACTAcAAATGAAAGGAGACGATTGAAAcTAATTA a t g g gc ac gt a t g c a 2650 2660 2670 2680 2690 2700 2710 2720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******* ** ************* ** ***** *********************** ** ** ********* ***** TGCCAGCTAGGTTTTATCCCAAAGTTACTAAATACTTCCCTTTGGATAAAGGTATTAAgCCtTACTATCCAGAGAATGTG a a ca c t a a t c g g c 2730 2740 2750 2760 2770 2780 2790 2800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ********** *** * * *** ***** ****************** **** *********************** GTTAATCATTACTTtAAAACTAGACAtTATTTACATACTTTGTGGAAGGCAGGAATTCTATATAAGAGAGAATCCACACA g c g g c c g a c a 2810 2820 2830 2840 2850 2860 2870 2880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******************************** ********* ************************ ***** ****** TAGCGCCTCATTTTGTGGGTCACCATATTCCTGGGAACAAGAGCTACAGCATGGGAGCACCTCTCTCAACGGCGAGAAGG k a c r 2890 2900 2910 2920 2930 2940 2950 2960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** *********** ** ***************************** *************** **************** GGCATGGGACAGAAtCTTTCTGTGCCCAATCCTCTGGGATTCTTTCCAGACCACCAGTTGGATCCACTATTCAGAGCAAA y c c m v y 2970 2980 2990 3000 3010 3020 3030 3040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *************** ************ ** ************** ********************* ***** *** * TTCCAGCAGTCCCGATTGGGACTTCAACACAAACAAGGACAATTGGCCAATGGCAAACAAGGTAGGAGTGGGAGGCTTCG c g g g c c t 3050 3060 3070 3080 3090 3100 3110 3120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **** ***************** ***** ******************** ************** ******* ****** GTCCAGGGTTCACACCCCCACACGGTGGCCTTCTGGGGTGGAGCCCTCAGGCACAGGGCATTCTgACAACCTCGCCACCA c t g a a t c 3130 3140 3150 3160 3170 3180 3190 3200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *********** ******* ** *************** * *************** ********** ********** GATCCACCTCCTGCTTCCACCAATCGGAGGTCAGGAAGAAAGCCAACCCCAGTCTCTCCACCTCTAAGGGACACACATCC c a c gc a t ac 3210 ....:....|....:... *** ACAGGCCATGCAGTGGAA nnnynnnnnnnnnnn ng |
| © 1998-2024 |  |  |  | Legal notice |