Dataset for nucleotide sequence Genomes of genotype H
[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]
| 10 20 30 40 50 60 70 80 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * ** *** * * ** ******* ***** ********************** *** CTCAACACAGTTCCACCAAGCACTGTTGGATCCGAGAGTAAGGGGtCTGTATtTTCCTGCTGGTGGCTCCAGTTCAGAAA nnnnct ag ca aca tc a c a ct g g------c- a c - g - 90 100 110 120 130 140 150 160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **** * ** ** ********** ******* **** **** ******** ************** *********** CACAGAACCCTGCTCCGACTATTGCCTCTCTCACATCATCAATCTTCTCGAAGACTGGGGACCCTGcTATGAACATGGAG a g y tg t g g c m tyc 170 180 190 200 210 220 230 240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ********************* ********* *********** ***** ***** ********** *** ********* AACATCACATCAGGACTCCTAGGACCCCTTCTCGTGTTACAGGCGGTGTGTTTCTTGTTGACAAAAATCCTCACAATACC a c g t c g g 250 260 270 280 290 300 310 320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ************************************** ************************************** AcAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGGTACCACCCGGGTGTCCTGGCCAAAATTCGCAGTCCC ag a 330 340 350 360 370 380 390 400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***************************************************** ************************** CAATCTCCAATCACTTACCAACCTCCTGTCCTCCAACTTGTCCTGGCTATCGTTGGATGTGTCTGCGGCGTTTTATCATC c 410 420 430 440 450 460 470 480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ************* ******* **** * *** ** ************************************ TTCCTCTTCATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTTGTTGGTTCTTCTGGACTATCAAGGTATGTTGCCCGTGTGTCCTCT g g tca cgt cct gtg 490 500 510 520 530 540 550 560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ************ **************** ******** *********** * ********** ******** ****** ACTTCCAGGATCTACAACCACCAGCACGGGACCCTGCAAAACCTGCACCACTCTTGCTCAAGGAACCTCTATGTTTCCCT at t g g y c c wc 570 580 590 600 610 620 630 640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** **** ***************************************** ************************ CCTGCTGCTGTACCAAACCTTCGGACGGAAATTGCACCTGTATTCCCATCCCATCATCTTGGGCTTTCGGAAAATACCTA t t t ta g 650 660 670 680 690 700 710 720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** ******************** **************** ** ***** *************** *********** TGGGAGTGGGCCTCAGCCCGTTTCTCTTGGCTCAGTTTACTAGTGCAATTTGtTCAGTGGTGCGTAGGGCTTTCCCCCAC t a c c c a c 730 740 750 760 770 780 790 800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ******* * *** ******** ********************** ** ********* ** ************* TGTCTGGCTTTTAGTTATATGGATGATtTGGTATTGGGGGCCAAATCTGTGCAGCATCTTGAGTCCCTTTATACCGCTGT t cg c g c a a g a g 810 820 830 840 850 860 870 880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ********************************* *** ** *********** ******* *** ** * ********** TACCAATTTTTTGTTATCTGTGGGCATCCATTTgAACACAGCTAAAACAAAAtGGTGGGGTTATtCCtTaCACTTTATGG a g t a c a c t r w c 890 900 910 920 930 940 950 960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** ******** ******** *********************** ********* * ****** ********** GTTATAtaATTGGGAGTTGGGGGACcTTGCCTCAGGAACATATTGTGCATAAAATCAAAGATTGCTTTCGCAAACTTCCC ggc c a a a g y t s g 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** *** **** *********** ** ******** ******************************** ******** ** GTgAATAGACCCATTGATTGGAAGGTTTGTCAACGcATTGTGGGTCTTTTGGGCTTTGCAGCCCCTTTTACTCAATGTGG t c t a c a c c r a 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ***************** ***** ** ** * ***** ************************************* TTATCCTGCTCTCATGCCCTTGTATGCCTGTATTACCGCTAAGCAGGCTTTTGTTTTCTCGCCAACTTACAAGGCCTTTC c a t c cr t a c 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * ****** *** ***** ***************** ** ********************************* TCTGTAAACAATACaTGAACCTTTACCCCGTTGCTCGGCAACGGCCAGGCCTTTGCCAAGTGTTTGCTGACGCAACCCCC ac c c c c rm a g g 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***************** *************** ******* ****** ****** ***** *********** ***** ACTGGCTGGGGCTTGGCGATTGGCCATCAGCGCATGCGCGGAACCTTTGtGGCTCCTCTGCCGATCCATACTGCGGAACT a c c ta g c a c 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ** ** *************** ************** ******* ** ******** ******** ********** CCTAGCaGCtTGTTTCGCTCGCAGCaGGTCTGGAGCGGACaTTATCGGCACTGACAACTCcGTTGTCCTTTCTCGGAAGT t c c c g a c t g c r 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******************** * ** ************************************** *************** ACACCTCCTTCCCATGGCTGCTaGGcTGTGCTGCCAACTGGATCCTGCGCGGGACGTCCTTTGTCTACGTCCCGTCGGCG a c t t a 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ************************ ***** ******* * ****** *********** ********** * ** CTGAATCCTGCGGACGACCCCTCTCGTGGTCGCTTGGGGCTCTgCCGCCCtCTTCTCCGCCTgcCGTTCCGGCCGACGAC a g tc a a c at at a tg c 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ************************** ********** **** ***** ************** *********** GGGTCGCACCTCTCTTTACGCGGACTCCCCGCCTGTGCCTTCTCATCTGCCGGCCCGTGTGCACTTCGCTTCACCTCTGC a g a ta g a g a 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** ***** *** ************ * * ********* **** **** ** ******** ** * ACGTCGCATGGAGACCACCGTGAACGCCCCTtgGAaCTTGCCAACAACCTTAcATAAGAGGACTCTTGGACTTTC---GC a ga m a caa g wc gt a a t c tatgta c yr - c- 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** **** ********** ******** ******** ******* ************ ********* *** CCCGGTCAACGACCTGGATTGAGGAATACATCAAAGACTGTGTATTTAAGGACTGGGAGGAGTCGGGGGAGGAGTTGAGG agaa t c c g g g a cca 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **** * * * **** **************************** ***** ****** ****** ************ TTAAaGgTCTTTGTATTAGGAGGCTGTAGGCATAAATTGGTCTGTTCACCAGCACCATGCAACTTTTTCACCTCTGCCTA t a t a c yk c ttc c g 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ** *** ******* **************************************** ****** ** **** ** ATCATCTTTTGTTCATGTCCCACTGTTCAAGCCTCCAAGCTGTGCCTTGGGTGGCTTTGGGGCATGGACATtGACCCTTA g g cw w t a g c t t 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******************** ********* * *** ***** *** **** **** ***** **** ** ******* TAAAGAATTTGGAGCTTCTGTGGAGTTACTCTCATTTTTGCCTTCTGAcTTCTTCCCGTCTGTCCGGGACCTACTCGACA c gy m c aa t a c g t g 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** ******** * **** *********** ** ** ****** **** *** ** ** ********* * ** CCGCTTCAGCCCTCTACCGAGATGCCTTAGAATCACCcGAACATTGCACCCCCAACCAcACTGCTCTCAGGCAAGCTATT a ct a g t a t t tcg t a ca t g t y 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******* * *** * * * ** * * ******************* * **** * * *** **** ** ** TTGTGCTGGGGTGAGTTGATGACcTTGGCTTCCTGGGTGGGCAATAATTTAGAGGATCCTGCAGCaAGAGATCTAGTAGT cc c g g a c gat c g ga c t ag ggt c a t g ta a ac t 2170 2180 2190 2200 2210 2220 2230 2240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ************ ** * ** ** ****** ***** ** * ******** ***** ******** ***** * ** TAATTATGTCAATACTAAcATGGGcCTAAAAATTAGACAATTATTATGGTTTCAcATTTCcTGCCTTACATTTGGAAGAG cg c t a t c atg cc g t t g g a g g 2250 2260 2270 2280 2290 2300 2310 2320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * *** ******** ********************** ** ***** * *** ********************* AAACTGTgCTTGAGTATTTGGTGTCTTTTGGAGTGTGGATtCGCACTCCACCTGCTTAtAGACCACCAAATGCCCCTATC tgt ta c c t tgya g c g t 2330 2340 2350 2360 2370 2380 2390 2400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** ** **** *** * **** ****** *********** ****** ************************* CTATCAACACTTCCGGAGACTACTGTTgTTAGACAACGAGGCAGGGCCCCTAGAAGAAGAACTCCCTCGCCTCGCAGACG r c ga t tg tg a cc t g g 2410 2420 2430 2440 2450 2460 2470 2480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******* **** ********* ********* ******* ***** * ********* ** ****************** AAGATCTCAATCaCCGCGTCGCAGAAGATCTCAATCTCCAGCTTCCCAATGTTAGTATTCCTTGGACTCATAAGGTGGGA a t c c t a g c g g 2490 2500 2510 2520 2530 2540 2550 2560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ********** ****** ****** ******* * ******** *** ******* ********* ******* * AACTTTACCGGTCTTTACTCCTCTACTaTACCTGTTTTCAATCCTGACTGGTTAACTCCTTCTTTTCCTGACATTCACTT t w t gc a t t c c a tc r 2570 2580 2590 2600 2610 2620 2630 2640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ********* ******* ******** ******** ************ ****** **** ******** * *** GCATCAAGATcTGATACAAAAATGTGAACAATTTGTaGGCCCACTCACTAcAAATGAAAGGAGACGATTGAAAcTAATTA a t g g gc ac gt a t g w ca a 2650 2660 2670 2680 2690 2700 2710 2720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******* ** ************* ** ***** ** ******************** ** ** ********* ***** TGCCAGCTAGGTTTTATCCCAAAGtTACTAAATACTTCCCTTTGGATAAAGGTATTAAgCCtTACTATCCAGAGAATGTG a a ga c t t a a t c c g c 2730 2740 2750 2760 2770 2780 2790 2800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ********** *** * * *** ***** ****************** **** ****** **************** GTTAATCATTACTTtAAAACTAGACAtTATTTACATACTTTGTGGAAGGCAGGAATTCTATATAAGAGAGAATCCACACA g c g g c c g a c m a 2810 2820 2830 2840 2850 2860 2870 2880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******************************** ********* ************************ ***** ****** TAGCGCCTCATTTTGTGGGTCACCATATTCCTGGGAACAAGAGCTACAGCATGGGAGCACCTCTCTCAACGGCGAGAAGG k a c r 2890 2900 2910 2920 2930 2940 2950 2960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** *********** ** ***************************** *************** **************** GGCATGGGACAGAAtCTTTCTGTGCCCAATCCTCTGGGATTCTTTCCAGACCACCAGTTGGATCCACTATTCAGAGCAAA y c c m v y g 2970 2980 2990 3000 3010 3020 3030 3040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *************** ************ ** ************** *** **************** ***** *** * TTCCAGCAGTCCCGATTGGGACTTCAACACAAACAAGGACAATTGGCCAATGGCAAACAAGGTAGGAGTGGGAGGCTTCG c g g g ca c c t 3050 3060 3070 3080 3090 3100 3110 3120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **** ***** *********** ***** ******************** ***** ******** ******* ****** GTCCAGGGTTCACACCCCCACACGGTGGCCTTCTGGGGTGGAGCCCTCAGGCACAGGGCATTCTgACAACCTCGCCACCA c t t g a r a t c 3130 3140 3150 3160 3170 3180 3190 3200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** ***** ******* ** *************** * ********* ***** ********** * ******** GATCCACCTCCTGCTTCCACCAATCGGAGGTCAGGAAGAAAGCCAACCCCAGTCTCTCCACCTCTAAGGGACACACATCC w c a c gm a a t ac g c 3210 ....:....|....:... *** ACAGGCCATGCAGTGGAA nnnygnnnnnnnnnn nn m |
| © 1998-2024 |  |  |  | Legal notice |