HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for nucleotide sequence C of genotype H

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
***** ** **** ** ******************** ***** ***  * *** *****  *** **** **** ** *
ATGGACATTGACCCTTATAAAGAATTTGGAGCTTCTGTGGAGTTACTCTCATTTTTGCCTTCTGACTTCTTCCCGTCTGT
     g  c    t  t                    c     k   gy m   c     aa   t    a    c  a


        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* **** ** * ********** ********  * **** *********** ** ** ****** ****   **  ** *
CCGGGACCTACTCGACACCGCTTCAGCCCTCTACCGAGATGCCTTAGAATCACCcGAACATTGCACCCCCAACCAcACTG
g    t  g y          a        ct a    g           t  a  t      t    tcg  rt  a
                                                      t                    y

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*  ********* * **  *** *** * *** * * *   ** * *  ********** ******** * ****  *
CTCTCAGGCAAGCTATTTTGTGCTGGGGTGAGTTGATGACcTTGGCTTCCTGGGTGGGCAATAATTTAGAGGATCCTGCA
ca         t g  cc   t   c g   g a c gaa  c g ga          c        c t    ag gg
                                       tt                           a         ac

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* *** **** ** *************    * * ** ** ****** *****   **  * **** *** ***** *
GCaAGAGATCTAGTAGTTAATTATGTCAATACTAAcATGGGcCTAAAAATTAGACAATTATTATGGTTTCAcATTTCCTG
t c   a    t  g             gcga c t  a  t      c     atg  cc g    y   t     t s
  t                                                    g   g  r

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*** ** ***** * ***   ***  ******** ***** ********* ****** ** *****      *** ****
CCTTACATTTGGAAGAGAAACTGTgCTTGAGTATTTGGTGTCTTTTGGAGTGTGGATtCGCACTCCACCTGCTTAtAGAC
   a  g     g a   tgt   ta        c     y         g      c  t     ggyacg   c
                                                                  t t

       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
******************* ** **  **** ***  *  **** ******  *********** ****** ********
CACCAAATGCCCCTATCCTATCAACACTTCCGGAGACTACTGTTgTTAGACAACGAGGCAGGGCCCCTAGAAGAAGAACT
                   r  c  ga    t   tg tg    a      cc           t      g
                   g

       490       500       510       520       530       540       550
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|..
*********** ************ **** ********* ********* ***** * ***** * ******
CCCTCGCCTCGCAGACGAAGATCTCAATCaCCGCGTCGCAGAAGATCTCAATCTCCAGCTTCCCAATGTTAG
           y            a    t         c         c     g t     a r
                             g                                   g