HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for nucleotide sequence PreS2 of genotype G

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*******   *** **     ** ********** ********** ********           **************
ATGCAGTGGAACTCTACAGCAtTCCACCAAGCTCTACAAAATCCCAAAGTCAGGGGCCTGTATtTTCCTGCTGGTGGCTC
c       ---   c  ccagg  t          g          c        --------c--
                    c                                          -

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
********  * *      **** ***** *********** **  ** ********* * * ** ***** ** *****
CAGTTCAGGGATAGTGAACCCTGTTCCGACTATTGCCTCTCACATCTCGTCAATCTTCTCCAGGATTGGGGACCCTGCAC
        aa c ccagga    c     a           t  ca  a         a g a  c     g  t
              a

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**** ******** ************ ********************* ******** *  **** *********** **
CGAACATGGAGAACATCACATCAGGATTCCTAGGACCCCTGCTCGTGTtACAGGCGGGGTTTTTCTTGTTGACAAGAATC
    t        t            c                     c        t gg    g           t
                                                            a

       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
********** **** ************************************** **  ********************
CTCACAATACCGCAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGGGAGTGCCCGTGTGTCCTGGCCTAAA
t          a    a                                      a  ca


       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
***************************** ****** ******************** **************  ******
TTCGCAGTCCCCAACCTCCAATCACTCACCAATCTCCTGTCCTCCAACTTGTCCTGGCTATCGCTGGATGTGTCTGCGGC
                             t      t                    a              gt


       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
********************************************************************************
GTTTTATCATATTCCTCTTCATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTTGTTGGTTCTTCTGGACTATCAAGGTATGTTGCCC



       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
******** ****** ********** ******** ************************ *******************
GTTTGTCCTCTGATTCCAGGATCCTCGACCACCAGTACGGGACCCTGCAAAACCTGCACGACTCCTGCTCAAGGCAACTC
        c      t          c        c                        t


       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*********************** ***** ******  ****************************  ************
TATGTATCCCTCATGTTGCTGTACAAAACCTTCGGACGGAAATTGCACCTGTATTCCCATCCCATCATCTTGGGCTTTCG
                       t     t      aa                            ga


       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**************** ********** ********* ******************************************
CAAAATACCTATGGGAGTGGGCCTCAGTCCGTTTCTCtTGGCTCAGTTTACTAGTGCCATTTGTTCAGTGGTTCGTAGGG
                t          c         a
                c

       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
******* ****** ***** **** *** * ****** * *** ***** **** ******** ***************
CTTTCCCCCACTGTCTGGCTTTCAGCTATaTgGATGATGTGGTATTGGGGGCCAAATCTGTACAACATCTTGAGTCCCTT
       a      t     c    t   g t      a t   c     a    g        g
                               c

       810       820       830       840
....:....|....:....|....:....|....:....|....:.
* ********************** ****** **********  **
TaTACCGCTGTTACCAATTTTCTTtTGTCTTTGGGTATACATCTAA
t                      g      a          tc