Dataset for nucleotide sequence PreS1 of genotype G
[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]
10 20 30 40 50 60 70 80 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** * * **** * *** * *** ***** ********* ***** ******* ATGGGGCTTTCTTGGACGGTCCCTCTCGA---GTGGGGAAAGAACCTTTCCACCAGCAATCCTCTAGGATTCCTTCCCGA aggg ggactt caca gga aggcat g c t tgttcc g tt a a a g a 90 100 110 120 130 140 150 160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ******** ** ** *** **** ** * *********************** ***** ******* ******* TCACCAGTTGGACCCaGCATTCAGAGCAAATACCAACAATCCAGATTGGGACTTCAATCCCAAAAAGGACCCTTGGCCAG t t g g g c ct a c c a c t c 170 180 190 200 210 220 230 240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * *** * * ******* ***** * ** ** ************** ******** ** ************ ** AGGCCAACAAGGTAGGAGTTGGAGCCTATGGACCCGGGTTCACCCCTCCACACGGAGGCCTTTTGGGGTGGAGCCCTCAG a c tc a cg a tc g a t t gc t ca c g 250 260 270 280 290 300 310 320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ********* * ****** * ******* *** ** ******* ******** ****** * ******* ***** TCTCAGGGCACACTAACAACTTTGCCAGCAGATCCGCCTCCTGCCTCCACCAATCGTCAGTCAGGGAGGCAGCCTACTCC g t t acg a t t ca a g a ac g c a 330 340 350 360 370 380 390 400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** * ****** ** ******** ************ ******* *** ** ** ********** ** *** CATCTcTCCACCACTAAGAGACAGTCATCCTCAGGCCATGCAGTGGAACTCTACAGCAtTCCACCAAGCTCTACAAAATC a t t g y c --- c ccagg t t rg a c g 410 420 430 440 450 460 470 480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** * **** * ********************** * * * ** ***** ********** CCAAAGTCAGGGGCCTGTATt---TTCCTGCTGGTGGCTCCAGTTCAGGGATAGTGAACCCTGTTCCGACTATTGCCTCT g a --------- cttc-- aa c ccagga t c a c t - a 490 500 510 520 530 540 550 560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** ********* * * ** ***** ** ** * **** ******** ************ **** ******** CACATCTCGTCAATCTTCtCCAGGATTGGGGACCCTGCACCGAACATGGAGAACATCACATCAGGATTCCTAGGACCCCT t ca a a g a c g t t a t t c c g a 570 580 590 600 610 620 630 640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******** ******** **** ********* * ** ********** **** *********************** GCTCGTGTtACAGGCGGGGTTTTTCTTGTTGACAAGAATCCTCACAATACCGCAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTC c tagg g a t t a a a 650 660 670 680 690 700 710 720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *************** * ********* ***** ******************************** ** *** *** TCAATTTTCTAGGGGGAGTGCCCGTGTGTCCTGGCCTAAATTCGCAGTCCCCAACCTCCAATCACTCACCAATCTCCTGT a acaa t a t c t 730 740 750 760 770 780 790 800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******* ********* ************** **************** ***************************** CCTCCAACTTGTCCTGGCTATCGCTGGATGTGTCTGCGGCGTTTTATCATATTCCTCTTCATCCTGCTGCTATGCCTCAT t a gt c 810 820 830 840 850 860 870 880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ********************* ***** ******************** ** *** ********** ******** **** CTTCTTGTTGGTTCTTCTGGACTATCAAGGTATGTTGCCCGTTTGTCCTCTGATTCCAGGATCCTCGACCACCAGTACGG t r c a t c c 890 900 910 920 930 940 950 960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **** **** ********** ****************************************** ***** ****** ** GACCCTGCAAAACCTGCACGACTCCTGCTCAAGGCAACTCTATGTATCCCTCATGTTGCTGTACAAAACCTTCGGACGGA a g t t t aa 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******************************************************** **** ***** ********* ** AATTGCACCTGTATTCCCATCCCATCATCTTGGGCTTTCGCAAAATACCTATGGGAGTGGGCCTCAGTCCGTTTCTCtTG t t c a c c 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ************** ******************************** ****** ***** **** *** * ****** * GCTCAGTTTACTAGTGCCATTTGTTCAGTGGTTCGTAGGGCTTTCCCCCACTGTCTGGCTTTCAGCTATaTgGATGATGT c a t c t g t a c 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ********* **** ******** ** ****** ** *** ********************** * ************* GGTATTGGGGGCCAAATCTGTACAACATCTTGAGTCCCTTTaTACCGCTGTTACCAATTTTCTTtTGTCTTTGGGTATAC t a g m c g a t g t g ....:. ** ** ATCTAA tc |