Dataset for nucleotide sequence PreS1 of genotype F
[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]
10 20 30 40 50 60 70 80 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *********** ** * **** ** * * * ***** * ** ***** ** ***** *** * ** * ATGGGAGCACCTCTcTCAACGACacGAAGgGGCATGGGACaGAATCTcTCTGTgCCCAATCCtCTGGGaTTCTTtCCAGA a ta a t t a a c c g r g g 90 100 110 120 130 140 150 160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** ******* * **** ***** *** ** * ** ***** ****** ****** ******* CCATCAGCTGGATCCtCTaTTCAGgGCAAATTCCAGCAGTCCCGAcTGGGACTTCAACAaAAACAAGGACAaTTGGCCAA a t g t aa t c gc c g 170 180 190 200 210 220 230 240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ***** ** * ** * * ** * * ** * ** ** *** * * ** * * TGGCAAACAAGGTAGGA---GTGGGAGGaTACGGTCCaGGGTTCACACC---CC---caCACGGTGGCCTGtTGGGGTGG g ct c t t c -ca -- t c a c c t 250 260 270 280 290 300 310 320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** * ** ** ** * * ** * ** * ** *** * ********* * * AGcCCtCAGGCACAgGGTGTgcTaACAACcTTGCCAGCAGATCCGCCTCCTGCTTCCACCAATCGGCGGTCCGGGAGaAA t a a a a tt t a tga a cc a aa g a g c g r 330 340 350 360 370 380 390 400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * * ** ** ** ** ** * * ** ** gCCAACCCCAGTCTCTCCACCTCTAAGAGACACaCATCCACAGGCcATGCAGTGGAACTCaACcCAGTTCCACCAGGCtC a t ag a a ta ct t t t aa ct c 410 420 430 440 450 460 470 480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * **** * * ** * * ** ** ** ** * **** TGTTaGATCCgAGGGTAAGGGCTCTGTATtTtCCTGCTGGTGGCTCCAGTTCAGaGACaCAGAACCCTGCTCCGACTATT g c c aa a -----cc-c ga g a t a g-- - 490 500 510 520 530 540 550 560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * *** **** * ** * *** * ** ** * ** ** * * ** ** ** GCCTCTCTCACATCATCAATCTTCTcGAAGACTGGGGGCCCTGCtAtGAACATGGAcAACATCACATCAGGACTCCTAGG y t c c t c c t c c g g ctt a a a a a 570 580 590 600 610 620 630 640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** * * * * * ** * * ** * * ** *** ** ** *** * ** *** ** ***** ACCCCTGCTCGTGTTACAGGCGGTGTGTTTCTTGTTGACAAAAATCCTCACAATACCACAGAGTCTAGACTCGTGGTGGA t c c t g a g g c 650 660 670 680 690 700 710 720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** ** ****** * * * * ***** ** ****** * * *********************** **** CTTCTCTCAATTTTCTAGGGGGActACCCGGGTGTCCTGGCCAAAATTCGCAGTCCCCAACCTCCAATCACTTACCAACC g a a ac a r c 730 740 750 760 770 780 790 800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ******* * ***** ** ***** * * ** ** ** ***** ****** ******* *********** ** TCCTGTCCTCCAACTTGTCCTGGCTATCGtTGGATGTGTCTGCGGCGTTTTATCATCTTCCTCTTCATCCTGCTGCTATG t c 810 820 830 840 850 860 870 880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** **************** **** * ***** ******** ***** * * CCTCATCTTCTTGTTGGTTCTTCTGGACTATCAAGGTATGTTGCCCGTTTGTCCTCTAcTTCCAGGATCcACGACCA--- g c g a tt a - 890 900 910 920 930 940 950 960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** *** *** **** **** ** ** **** * * ** * **** * ***** ** ** *** ---------CCAGCACGGGACCaTGCAAAACCTGCACAACTCTTGCTCAAGGAACCTCTATGTTTCCCTCcTGtTGCTGT a c g g a c t c t a 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * *** * *** ***** ***** *********** ***** ** ** *** ***** * ******** ** * TCcAAACCcTCGGACGGAAACTGCACtTGTATTCCCATCCCATCATCtTGGGCTTTAGGAAAATACCTATGGGAGTGGGC a a t c c m y 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **** ** ** *** * ***** **** ** *** * ** ***** * ** * * ********* *** **** ** CTCAGCCCGTTTCTCCTGGCTCAGTTTACTAGTGCAATTTGTTCAGTGGTGCGTAGGGCTTTCCCCCACTGTcTGGCTTT s t a c t t a k 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * **** ************ ** *** * * * * ** * * ** * * ** * ***** TAGTTATATGGATGATCTGGTATTGGGGGCCAAATCTGTGCAGCATCTTGAGTCCCTTTATACCGCTGTTACCAATTTTC g t a c t 1210 1220 ....:....|....:....|.... * **** **** ** * * * TGTTATCTGTGGGTATCCATTTaA t g |