Dataset for nucleotide sequence Genomes of genotype F
[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]
10 20 30 40 50 60 70 80 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** * * **** * * ** * * * CTCaACcCAGTTCCACCAGGCtCTGTTaGATCCgAGGGTAAGGGCTCTGTATtTtCCTGCTGGTGGCTCCAGTTCAGaGA t ct ta t t aa ct g c c aa a gcc-c ga a --- - 90 100 110 120 130 140 150 160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** ** ** * ***** * * * *** **** * ** ***** * ** ** * ** ** CaCAGAACCCTGCTCCGACTATTGCCTCTCTCACATCATCAATCTTCTcGAAGACTGGGGGCCCTGCTAtGAACATGGAc g a t y t c c t c c t c c g a a a 170 180 190 200 210 220 230 240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** * ** ** ** * * * * * ** * * ** * * ** *** ** ** ** AACATCACATCAGGACTCCTAGGACCCCTGCTCGTGTTACAGGCGGTGTGTTTCTTGTTGACAAAAATCCTCACAATACC g ctt a a t c c t g g a g c 250 260 270 280 290 300 310 320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** *** ** *********** ** ****** * * * * ***** ** ****** * * ***** ACAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGGGActACCCGGGTGTCCTGGCCAAAATTCGCAGTCCC g g a a ac a r c 330 340 350 360 370 380 390 400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ****************** ***** ******* * ***** ** ***** * * ** ** ** ***** ****** CAACCTCCAATCACTTACCAACCTCCTGTCCTCCAACTTGTCCTGGCTATCGtTGGATGTGTCTGCGGCGTTTTATCATC t c 410 420 430 440 450 460 470 480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******* *********** ******** **************** **** * ***** ******** ***** * TTCCTCTTCATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTTGTTGGTTCTTCTGGACTATCAAGGTATGTTGCCCGTTTGTCCTCT g c g 490 500 510 520 530 540 550 560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** *** *** **** **** ** ** **** * * ** * AcTTCCAGGATCcACGACCAC------------CAGCACGGGACCaTGCAAAACCTGCACAACTCTTGCTCAAGGAACCT a tt a c g g a c a 570 580 590 600 610 620 630 640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **** * ***** ** ** *** * * *** * *** ***** ***** *********** ***** ** ** *** CTATGTTTCCCTCcTGtTGCTGTTCcAAACCcTCGGACGGAAACTGCACtTGTATTCCCATCCCATCATCtTGGGCTTTA t c t a a t c c a m y 650 660 670 680 690 700 710 720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ***** * ******** ** * **** ** ** *** * ***** ******* *** * ** ***** * ** * GGAAAATACCTATGGGAGTGGGCCTCAGCCCGTTTCTCCTGGCTCAGTTTACTAGTGCAATTTGTTCAGTGGTGCGTAGG s t a c a k 730 740 750 760 770 780 790 800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ********* *** **** ** * **** * ***** **** ** *** ** * * * ** * * GCTTTCCCCCACTGTcTGGCTTTTAGTTATATGGATGATCTGGTATTGGGGGCCAAATCTGTGCAGCATCTTGAGTCCCT t t g t a 810 820 830 840 850 860 870 880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * ** * ***** * **** **** ** * * ** * * ** ** ** * ***** ** TTATACCGCTGTTACCAATTTTCTGTTATCTGTGGGTATCCATTTaAATACcTCtAAAACaAAAAGATGGGGTTAcaccc t t g g tg g g gc c ttatt t a 890 900 910 920 930 940 950 960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** ***** * ** * *** ** * ** ** ** * ** *** * ** * * * ** TAcATTTcATGGGTTATGTtATTGGcAGTTGGGGAtCaTTACCcCAAGATCAcATTGTACAcAAAaTCAAAGAtTGTTTT ca t a c t g g g a t a t a gc rg a c c a a a t 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** * *** ** ** * ** ***** ** ** ** * * ** ** * *** ** ** ** * * cGtAAACTTCCTGTAAATCGtCCaATTGAtTGGAAAGTTTGTCAaCGcATTGTGGGtCTTTTGGGCTTTGCcGCcCCtTT a a g c t a c c c g t a a c t t c g a c a g a 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ***** ** ** ** *********** * ** ** * ** ** * ** ***** ** **** ** * tACcCAATGTGGTTATCCTGCTCTCATGCCTcTGTATgCCTGTATaACTGCtAAACAGGCTTTTGTCTTTTCGCCAACTT c t c t a caat t c g g t c c a c c a 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ***** * ** *** ********** *** ******** * *** * *************** ACAAGGCCTTTCTcTGTaAACAaTACATGAACCTTTACCCCGTTGCTCGGCAACGGCCAGGCCTGTGCCAAGTGTTTGCT a a c g gc c ca g g 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** ** **** *** ****** * * * * ** ****** *** * ***** ****** * ******* GACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCTTGGCCATTGGCCATCAGCGCATGCGTGGAACCTTTGTGGCTCCTCTGCCGATCCA t t c a 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** ** ** * ** ** ** *** ** * *** *** * * * ** ** * ** * * * TACTGCGGAACTCCTTGCAGCtTGTTTCGCTCGCAGCCGGTCTGGAGCGAaacTcATCGGcACaGACAACTCTGTTGTCC a c c a cta t g g t c a gcg 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * ** ** * ** ** *********** ** ** *** ** ***** ** * ** **** ***** *** TCTCTaGGAAGTACACCTCCTTcCCATGGCTGCTCGGtTGTGCTGCcAACTGGATCCTgCGCGGGACGTCCTTTGTTTAC cc t a a a m g c 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** ** * ********* ** ***** ** ** **** ** * ** * * ** ** * * ** * *** GTCCCGTCGGCGCTGAATCCcGCGGACGAcCCCTCcCGGGGtCGCTTGGGGcTgTAcCGCCCcCTTCTcCGTCTGCcGTT a a a t t t c tc a ag c tt t g a t t a t 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** ***** * ****** * ***** * * ** *** *** * * **** ************ CCAGCCGACgACGGGTCGCACCTCTCTTTACGCGGaCTCCCCGTCTGTTCCTTCTCATCTGCCGGaCCGTGTGCACTTCG g a c c g g t a t 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *************** **** ** *** ***** *** * * * * CTTCACCTCTGCACGTCGCATGGAGACCACCGTGAACGCCCCctGgAgttTGCCAACAGTCTTACATAAgaGGACTcTTG a a a tc a acc c t c t c ac a a y c m 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** * *** * *** ** *** ** GACTTTCAGGAcGGTCA------------ATgACCTGGATCGAAGAATACATCAAAGACTGTGTATTTAAgGACTGGGAG c c a a ga --cc t c g ca g t -- g 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ** * ** * ** * * * ******* * * *** **** * GAGcTGGGGGAGGAGAttAGGTTAAaGgTCTTTGTAtTAGGAGGCTGTAGGCATAAATTGGTCTGTTCACCAGCACCATG t cc t a t a c cg 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * **** ****** ** * *** **** *** ******** *** ************ * **** CAACTTTTTCACCTCTGCCTAATCATCTTTTGTTCATGTCCtACTGTTCAAGCCTCCAAGCTGTGCCTTGGGTGGCTTTg c c a 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ********* **** * ******** ** ** ** ** * * * ***** * ** * * ** GGGCATGGACATTGACCCTTATAAAGAATTTGGAGCTTCTGTGGAATTaCTCTCTTTTTTGCCTTCTGAtTTCTTCCCgT a c c ac gc g g atc c at a g ca t g k 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * * **** * * * * * * ** * * * * ** CaGTTCGGGACCTACTCGACACCGCTTCAGCcCTcTACcGGGATGCTtTAGAgTCACCaGAACATTGCACcCCcaAcCAT gaca t a c t tctta gc ga a g g t a atc t c t g t t m 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * ** * * ** ** * * * *** *** * * ** * * * ACcGCTCTCAGGCAAGCTATtTTGTGcTGGGGTGAgTTAATGACTTTGGCTTCCTGGGTGGGcAATAAtTTGGAaGAcCC t ca t g ag a t aa ag cagt c ca tc c c g t c a t g c t 2170 2180 2190 2200 2210 2220 2230 2240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * * * * ** **** * ** * * ******* * TGCaGCtAGGGAttTAGTaGTTAAcTATGTcAAcACTaAcATGGGCcTaAAaATTAGACAAtTgtTGTGGTTTCACATTT gtt c cc c g t t t t c t t g g c a c ac rc g a 2250 2260 2270 2280 2290 2300 2310 2320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * ** * * ** * * * * * * * ****** * * *** ** ** CCTGcCTTACTTTTGGAAGAGAAACAGTTCTTGAGTATTTGGTGTCcTTTGGAGTGTGGATTCGCACTCCtCCtGCTTAT ta attg c tgt g ac t g agtacta c c a a 2330 2340 2350 2360 2370 2380 2390 2400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ******** **** **** ***** ** * * * * * * ** AGACCACCAAATGCCCCTATCcTATCCACACTTCCGGAAACTACTGTTGTTAGACGACGAGGCAGGTCCCCTaGAAGAAG g ga t gt g a gc a c annnnncnnnnnnn a t n 2410 2420 2430 2440 2450 2460 2470 2480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ****** *** *** * * * * **** ******* * ** ***** ** AACTCCCTCGCCTCGCaGACGAAGgTCTCAATCGCCGCGTCGCAGAAGATCTCAATCTCCAGCTTCCCAATGTTAGTATT nnnnnnnnnnnn ca a a g cac t gc 2490 2500 2510 2520 2530 2540 2550 2560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * *** * * ** ** ** ** ****** ** * *** * * ** * ** CCTTGGACTCATAAGGTGGGAAAtTTTACGGGgCTcTAcTCtTCTACTGTtCCTgCTTTtAATCCTgACTGGTTAACTCC c k c a a t t c a a c t a t gcc g g r c g 2570 2580 2590 2600 2610 2620 2630 2640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ****** * ***** * ** * * ** * ** ** * * ** ** ** * ** * * ** TTCTTTTCCTGAtATTCATTTaCATCAAGAtcTGATAtctAAATGTGAACAATTTGTAGGCCCtCTcACaAAAAATGAAT a c g cg ga ct a tcac g g t a t c a g a t 2650 2660 2670 2680 2690 2700 2710 2720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** *** * * ***** * * * * * ** * ** ***** ** * * ** * ** ** TgAGAAGaTTaAAATTggTtATGCCAgCcAGATTtTtTCCTAAggTTACcAAATAtTTTCCTaTGGAaAAaGGaATtAAA ac g g g aa c t t c a ac c t c cc a g g c c g t c g t t 2730 2740 2750 2760 2770 2780 2790 2800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * **** * * *********** ** * * ** *** * *** * *** * ** * CCcTATTATCCTGAgcAtGcaGTTAATCATTAtTTTAAgACcAGACAtTATTTGCATACTTTATGGAAgGCgGGaATttT t a ta cttg c c a a c c t a a c cc y r r r y 2810 2820 2830 2840 2850 2860 2870 2880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** * * * * * ** * ** ** ** ** * ** * ****** ** * ************** ATATAAGAGAGAATCCACACGTAGCGCCTCATTTTGTGGGTCACCATATTCcTGGGAACAAGAGCTACAGCATGGGAGCA r r r c a a t a 2890 2900 2910 2920 2930 2940 2950 2960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** * **** ** ***** *** * ** * ***** * CCTCTcTCAACGACacGAAGgGGCATGGGACaGAATCTcTCTGTgCCCAATCCtCTGGGaTTCTTtCCAGACCATCAGCT a ta a t t a a c c g r a g g 2970 2980 2990 3000 3010 3020 3030 3040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ****** * **** ***** *** ** * ** ***** ****** ****** * ********** * **** GGATCCtCTaTTCAGgGCAAATTCCAGCAGTCCCGAcTGGGACTTCAACAaAAACAAGGACAaTTGGCCAATGGCAAACA g t aa a t c gc c g 3050 3060 3070 3080 3090 3100 3110 3120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * *** * ** * * ** * * ** ** ***** *** * * ** * *** ** * ** ** AGGTAGGAG---TGGGAGGaTACGGTCCaGGGTTCACACCCCCACACGGTGGCCTGtTGGGGTGGAGcCCtCAGGCACAg g ct c t t t t c a t a a a c c 3130 3140 3150 3160 3170 3180 3190 3200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * ** * ** * ** *** * ********* * * * * GGTGTgcTaACAACcTTGCCAGCAGATCCGCCTCCTGCTTCCACCAATCGGCGGTCCGGGAGaAAgCCAACCCCAGTCTC a tt t a tga a cc a aa g a g a c g r 3210 3220 3230 3240 ....:....|....:....|....:....|....:....|.. ** * * * ** ** ** ** ** * TCCACCTCTAAGAGACACaCATCCACAGGCcATGCAGTGGAA t ag a a c |