HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for nucleotide sequence S of genotype E

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
               **             ****  * *    *   *  *     **           * ** ***
ATGGAAaGCATCACATCAGGATTCCTAGGACCCCTGCTCGTGTTACAGGCGGGGTTTTTCTTGTTGACAAAAATCCTCAC
     gga   t                            ca           a    c  c



        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*** **            *  *  *   *****   *     *  *            *  *    ***** ** **
AATACCGCAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGGGAGCTCCCGTGTGTCtTGGCCAAAATTCGC
       a a                            g           a t            g           t
                                                    a            c
                                                                 k

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*   * ** *  *   **** **     *     **       **   *      *  * *  *      ***  *  *
AGTCCCCAAcCTCCAaTCACTCACCAACCTCTTGTCCTCCAATTTGTCCTGGCTATCGCTGGATGTGTCTGCGGCGTTTT
         t     g                        g c         t     t



       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
      * *  *   * ** * *  *       *  *              * *   *  *   * ** **   **  **
ATCATCTTCCTCTTCATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTTGTTGGTTCTTCTGGACTATCAAGGTATGTTGCCCGTTTG
     a                                                        g
     m                                                        c


       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* *       **  ** *  * *  *        **           * * ***       * *        ****
TCCTCTAATTCCAGGATCATCAACCACCAGTACGGGACCCTGCCGAACCTGCACGACTCTTGCTCAAGGAACCTCTATGT
       c                      c           ta               c      c



       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  ***   *  **  *   *    *         **    * *    *  * ******  * ** * ** * * * *
TTCCCTCATGTTGCTGTTCAAAACCTTCGGACGGAAATTGCACTTGTATTCCCATCCCATCATCATGGGCTTTCGGAAAA
                  t            aa



       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* ********   ***  * ** ***** **      **  **  *  * **  * *  **  ** ****  *    * *
TTCCTATGGGAGTGGGCCTCAGCCCGTTTCTCCTGGCTCAGTTTACTAGTGCCATTTGTTCAGTGGTTCGCCGGGCTTTC
          g                     t          c                          ta
          t                     a


       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** **       * * *    **  * *   * * ***  ** *  * *    *   *  ** *   *  *  * *   *
CCCCACTGTCTGGCTTTCAGTTATATGGATGATGTGGTATTGGGGGCCAAGTCTGTACAACATCTTGAGTCCCTTTATAC
     t   t       t      g                      g gaa   c      c      g
     y


       650       660       670       680
....:....|....:....|....:....|....:....|.
   *    * ** ** **  *  *  ****  *
CtCTGTTACCAATTTTCTTTTGTCTTTGGGTATACATTTAA
tg    g  t                    c      c-g-
      a                                -