HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for nucleotide sequence S of genotype E

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
               **             * **             *  *     **           *  * *
ATGGAAaGCATCACATCAGGATTCCTAGGACCCCTGCTCGTGTTACAGGCGGGGTTTTTCTTGTTGACAAAAATCCTCAC
     gga   t                            ca           a    c



        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**  **    *       *  *  *   * ****        *  *            *  *    *** * ** **
AATACCGCAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGGGAGCTCCCGTGTGTCtTGGCCAAAATTCGC
                                      g           a t            g
                                                    a            c
                                                                 k

       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*   * ** *  *    * * *      *     **       **   *      *  * *         * *     *
AGTCCCCAAcCTCCAaTCACTCACCAACCTCTTGTCCTCCAATTTGTCCTGGCTATCGCTGGATGTGTCTGCGGCGTTTT
         t     g                        g c         t     t



       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
      * *      * ** * *  * ****  * ** *      *     * *          * **  *   **  **
ATCATCTTCCTCTTCATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTTGTTGGTTCTTCTGGACTATCAAGGTATGTTGCCCGTTTG
     a                                                        c
                                                              g


       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* *       **  ** *  * *  *        **           * *           *          ****
TCCTCTAATTCCAGGATCATCAACCACCAGTACGGGACCCTGCCGAACCTGCACGACTCTTGCTCAAGGAACCTCTATGT
       c          c           c           ta               c      c



       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  ***      **  *        *    *    **    * *    *  * ******  * **        *
TTCCCTCATGTTGCTGTTCAAAACCTTCGGACGGAAATTGCACTTGTATTCCCATCCCATCATCATGGGCTTTCGGAAAA
                  t



       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
* * ******   ***  * *  *****  *      **  **  *    **  * *  **   *   *   *    *
TTCCTATGGGAGTGGGCCTCAGCCCGTTTCTCCTGGCTCAGTTTACTAGTGCCATTTGTTCAGTGGTTCGCCGGGCTTTC
          g                     t       a  c         c                t
          t                     a


       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
** **       * * *    **  * *   *   ***  *  *  * *    *      ** *   *  *  * *   *
CCCCACTGTCTGGCTTTCAGTTATATGGATGATGTGGTATTGGGGGCCAAGTCTGTACAACATCTTGAGTCCCTTTATAC
     t   t       t      g                      g gaa                 g



       650       660       670       680
....:....|....:....|....:....|....:....|....
          *  ** *   *  *  ****  *
CTCTGTTACCAATTTTCTTTTGTCTTTGGGTATACA-T--TTAA
tg    g  t                    c         c--t
      a                                   g-