HBVdb::Dataset - Hepatitis B Virus Database

Dataset for nucleotide sequence PreS2 of genotype E

[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]

        10        20        30        40        50        60        70        80
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
       **   *        ** *                   *                        * ******
ATGCAGTGGAATTCCACAACaTTCCACCAAGCTCTGCAGGATCCCAGAGTAAGAGGCCTGTATtTTCCTGCTGGTGGCTC
g a  a       a  agg t  t  ta  a    a  a       a   g ag at     -c-c
                                                               -

        90       100       110       120       130       140       150       160
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   **  *  *           * **      * *  *  * *   **  **     *   * *  *** *     *
CAGTTCCGGAACAGTgAACCCTGTTCCGACTACTGCCTCaCTCATCTCGTCAATCTTCTCGAGGATTGGGGACCCTGCAC
               a g                 t   t     a                            t


       170       180       190       200       210       220       230       240
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
     ** *         * **      ***    ****        **   *  **   ***    * * * **  * *
CGAACATGGAAaGCATCACATCAGGATTCCTAGGACCCCTGCTCGTGTTACAGGCGGGGTTTTTCTTGTTGACAAAAATC
          gga   t                             a           a    c


       250       260       270       280       290       300       310       320
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
     *** **   **      **  * **   * ****       **  * * *        *  *    *** * **
CTCACAATACCGCAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGGGAGCTCCCGTGTGTCTTGGCCAAAA
                                           g           a t            c
                                                                      g

       330       340       350       360       370       380       390       400
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
**  * *  ** ** *  *  * * * *  *   *     **       ** * **  *  *  * * *    *  * *
TTCGCAGTCCCCAAcCTCCAaTCACTCACCAACCTCTTGTCCTCCAATTTGTCCTGGCTATCGCTGGATGTGTCTGCGGC
  t           t     g              t         g cc        t     t


       410       420       430       440       450       460       470       480
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*   *      * *   * ***** * *  * ***** * ** *  *  ** **  * **    *    * **  **  *
GTTTTATCATCTTCCTCTTCATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTTGTTGGTTCTTCTGGACTATCAAGGTATGTTGCCC
          a                                                        c


       490       500       510       520       530       540       550       560
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*  *** * *     **  ** *  * *  *  *     **        *  * *     *     *        * ***
GTTTGTCCTCTAATTCCAGGATCATCAACCACCAGTACGGGACCCTGCCGAACCTGCACGACTCTTGCTCAAGGAACCTC
            c        a c           c           ta               c       a


       570       580       590       600       610       620       630       640
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
*      ***  *   **  *   * *  *    *    ***   * *   **  * ****** ** **       **
TATGTTTCCCTCATGTTGCTGTTCAAAACCTTCGGACGGAAATTGCACTTGTATTCCCATCCCATCATCATGGGCTTTCG
                       t


       650       660       670       680       690       700       710       720
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
   * * * ******   ***  * *  *****  *    * **  ** ** *  **  * ** **   *   *   *
GAAAATTCCTATGGGAGTGGGCCTCAGCCCGTTTCTCCTGGCTCAGTTTACTAGTGCCATTTGTTCAGTGGTTCGCCGGG
               g                     t                    c                ta


       730       740       750       760       770       780       790       800
....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|
  *  ** ** **  * *** *    **  **** *** ****  ****  * *   **      ** *   *  *  **
CTTTCCCCCACTGTCTGGCTTTCAGTTATATGGATGATGTGGTATTGGGGGCCAAGTCTGTACAACATCTTGAGTCCCTT
          t                                         g  aa


       810       820       830       840
....:....|....:....|....:....|....:....|....:.
*   *  *     * ** ** **  *  *  **** **  *
TATACCTCTGTTACCAATTTTCTTTTGTCTTTGGGTATACATTTAA
     tg    g                       c      c--t
                                            g