Dataset for nucleotide sequence Genomes of genotype E
[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]
10 20 30 40 50 60 70 80 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * * ******* ** * * TTCCACAACATTCCACCAAGCTCTGCAGGATCCCAGAGTAAGAGGCCTGTATttTCCTGCTGGTGGCTCCAGTTCCGGAA a a g t a a aa a-----a----------c-- g g -g at -cc 90 100 110 120 130 140 150 160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * ** *** * * * ** *** * * * * * *** * * * ** * CAGTGAACCCTGTTCCGACTACTGCCTCACTCATCTCGTCAATCTTCTCGAGGATTGGGGACCcTGCACCGAACATGGAA a g t t a t g c 170 180 190 200 210 220 230 240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** *** **** ** ** ******* ** *** * * * * ** ** *** *** ** AGCATCACATCAGGATTCCTAGGACCCCTGCTCGTGTTACAGGCGGGGTTTTTCTTGTTGACAAAAATCCTCACAATACC ga t a a 250 260 270 280 290 300 310 320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ** **** ************ * ** ***** * * * ***** ** ** * * ** GCAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGGGAGCTCCCGTGTGTCTTGGCCAAAATTCGCAGTCCC g a t g t a c 330 340 350 360 370 380 390 400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * ***** ** * *** ** ** ** * * **** * *** ** ** * CAAcCTCCAaTCACTCACCAACCTCTTGTCCTCCAATTTGTCCTGGCTATCGCTGGATGTGTCTGCGGCGTTTTATCATC t g t g c g t t a 410 420 430 440 450 460 470 480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** ***** * ** * ***** ******* * ** **** ** ** ** * ** **** ** *** * * TTCCTCTTCATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTTGTTGGTTCTTCTGGACTATCAAGGTATGTTGCCCGTTTGTCCTCT c 490 500 510 520 530 540 550 560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** **** * * * * ** * * * *** ** * ** * **** **** AATTCCAGGATCATCAACCACCAGTACGGGACCCTGCCGAACCTGCACGACTCTTGCTCAAGGAACCTCTATGTTTCCCT c c c a c g ca 570 580 590 600 610 620 630 640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** ** * * ** * *** * * ** ******** ** ** ******** * ***** **** CATGTTGCTGTTCAAAACCTTCGGACGGAAATTGCACTTGTATTCCCATCCCATCATCATGGGCTTTCGGAAAATTCCTA c t aa 650 660 670 680 690 700 710 720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **** ******* ** ***** ** ** ** ** ***** ** * ** ** ******** ** ******* ** TGGGAGTGGGCCTCAGCCCGTTTCTCCTGGCTCAGTTTACTAGTGCCATTTGTTCAGTGGTTCGCCGGGCTTTCCCCCAC g t ta t 730 740 750 760 770 780 790 800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * ***** * ** ************* **** * * ** * ** ** * * * * *** ** TGTCTGGCTTTCAGTTATATGGATGATGTGGTATTGGGGGCCAAGTCTGTACAACATCTTGAGTCCCTTTATACCTCTGT t t g gaa c g tg 810 820 830 840 850 860 870 880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ***** ** * * **** ** * * ** * ** ***** ** * * * **** TACCAATTTTCTTTTGTCTTTGGGTATACATTTAAATcCCAACAAAACAAAAAGATGGGGATATTCCCTaaATTTCATGG g c c g t t c c g tt gc c t g a t g c 890 900 910 920 930 940 950 960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * *** *** ** * * ** ** * ** ** ** *** * ***** * ** ** ** GTTATGTAATTGGaAGTTGGGGgTCATTACCACAgGAaCACATCAgAaTGAAAATCAAAGACTGTTTTAGAAAACTCCCT ca t a c g g a t tca tca g t cc g t a c c c c c c 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * * ** ***** * * * * * ** ** * * ** * ** ** ** ** ***** ** GTTAAcCGGCCTATTGATTGGAAAGTATGTCAAaGAATTGTGGGTCTtTTGGGCTTTGCTGCCCCTTTTACACAATGTGG c ta a c c gc gc c g a t c g g a c 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** ** **** ** * * ** * ***** ** ** * * ** * * * ** aTATCCTGCTTTAATGCCTCTgTATGCGTGTATTCAATCTAAGCAGGCTTTCACTTTCTCGCCAACTTACAAGGCCTTTC g g t a a a c cc ggac g a t t t a g a ct c a r c g 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** ***** ***** * * * *** * * ******** ***** ** ***** *** TGTGTAAACAATAccTGAACCTTTACCCCGTTGCCCGGCAACGGCCaGGTCTGTGCCAAGTGTTTGCTGATGCAACCCCC a a ccc g ta gc t t c c t 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** ********* * * * * * ** * ** *** * * ** * * *** * ** **** ACTGGCTGGGGCTTGGCCATAGGCCATCAGCGCaTGCGtGGAACCTTTGTGGCTCCTCTGCCGATCCATACTGCGGAACT t t g at c a c c a a a g c g 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** ***** *** **** * **** ** * ** ** * ** ** ** ** ** ** * ** CCTAGCCGCTTGTTTTGCTCGCAGCAGGTCTGGAGCgAAACTTATCGGGACaGATAATTCTGTCGTTCTCTCcCGGAAAT t g a c c g a cc c a a t c c t c a a t g t c 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * ** ****** **** ** * **** ** *** * ** *********** * * *** * *** ATACATCaTTTCCATGGCTGCTAGGCTGTGCTGCCAACTGGATCCTGCGAGGGACGTCCTTTGTCTACGTCCCGTCAGCG c c a aa t g g t 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * * ****** ** * * ** * * ** * *** * ** ** * ** * * ** CTGAATCCTGCGGACGACCCgTCTCGGGGTCGCTTGGGGaTCTaTCGTCCCCTTCTCCGTCTGCCGTTCCaGCCGACCAC c c c c g t cc a a ga at a g t 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * ** * * * *** * * ***** * ** ** * * ** *** * * *** * * ****** GGGGCGCACCTCTCTTTACGCGGTCTCCCCGTCTGTgCCTTCTCATCTGCCGGaCCGTGTGCACTTCGCTTCACCTCTGC a t a gc c t t a g c 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **** ***** ** **** * * * *** ** * ** ***** * **** ACGTCGCATGGAGACCACCGTGAACGCCCAC------CAAaTcTTGCCCAAGGTCTTACATAAGAGGACTCTTGGACTCT a t t ggcga t c t t g 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******** * ******** * **** * ** * ** ** * ** ***** * ******** CtGCAATGTCAACGACCGACCTTGAGGCATACTTCAAAGACTGTTTGTTTAAAGACTGGGAGGAGTtGGGGGAGGAGAtT ag t g g a c cc c g 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * *** **** ******** **** * ** ** * ***** ** **** AGaTTAAaGgTCTTTGTACTAGGAGGCTGTAGGCATAAATTGGTCTGCGCACCAGCACCATGCAACTTTTTCACCTCTGC g c ct a g ct c g t t g 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ** * ** * *** * * ***** * * * ** ***** *** **** ** ***** * ** * CTAATCATCTCTTGTTCATGTCCTACTGTTCAAGCCTCCAAGCTGTGCCTTGGGTGGCTTTgGGgCATGGACATTGACCC a a c t r y 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** *** ***** * * * ** ******** ** ** * ** * * * * TTATAAAGAATTTGGAGCTaCTGTGGAGTTACTCTCGTTTTTGCCTTCTGACTTCTTTCCTTCAGTAAGAGATCTTCTAG gt c c t ggac t t a ag ca t a a ag c 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** * * ** * * **** ATACCGCCTCaGCTCTGTATCGGGATGCCTTAGAATCTCCTGAGCATTGTTCACCtCACCAcACtGCACTCAGGCAAGCC t a t t c t g g t a gtca g g t t g ta t c c c 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * *** * * * ** **** ** ** ** * * * * ** * ATTCTTTGCTGGGGgGAacTAATGAcTCTAGCTACCTGGGTGGGtGtAAATTTGGAAGATCCAGCATCCAGGGACCTAGT g a g t a ct t tact gc a g ct c ac c c act t a atat t tg g a g a a t g a 2170 2180 2190 2200 2210 2220 2230 2240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ***** ** * * * ** * * ** ** ** * ** ** AGTCAGTTATGTCAATACTAATATGGGCCTAAAGTTCAGGCAATTATTGTGGTTTCACATTTCTTGTCTCACTTTTGGAA g tg t cga c g cat a a t c ca t tg c g 2250 2260 2270 2280 2290 2300 2310 2320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * * ** ** * ** * *** * ******* * ** * ** ******** GAGAAACcGTCaTAGAGTATTTGGTGTCTTTTGGAGTGTGGATTCGCACTCCTCCAGCTTATAGACCACCAAATGCCCCT c tgtt tg tc a c aatc c g g a c a at tc c 2330 2340 2350 2360 2370 2380 2390 2400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * * *** ** * ***** ***** *** * * ** * ******* ** ATCTTATCAACACTTCCGGAGAaTACTGTTGTTAGACGAAGAG------GCAGGTCCCCTAGAAGAAGAACTCCCTCGCC c t c a c - c c a t 2410 2420 2430 2440 2450 2460 2470 2480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** * ** *** ** *** * * **** *** * * * * * ** ** * * * TCGCAGACGAAGATCTCAATCGCCGCGTCGCAGAAGATCTCAATCTCCAGCTTCCCAATGTTAGTATTCCTTGGACTCAC c c tg agc g t 2490 2500 2510 2520 2530 2540 2550 2560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** **** * ** * ** *** * * ** ** * * ** * * ** ** AAGGTGGGAAATTTTACGGGGCTTTAcTCTTCTACTATACCTGTCTTTAATCCTAACTGGAAAACTCCATCTTTTCCTGA t a c t t a t cg c t t c a c 2570 2580 2590 2600 2610 2620 2630 2640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** * * ** ** * * * ** * ** * ** ** ** * ** * * * * * * TATTCATTTGCACCAGGACATTATTAACAAATGTGAACAATTTGTAGGTCCTCTAACAGTAAATGAAAAACGAAGATTAA c a a t c g t g g c ct t t a g gc g 2650 2660 2670 2680 2690 2700 2710 2720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ***** * * ** * *** ** ** ** * ** ** ** * ** * ** ** * AcTTAGTcATGCCTGCTAGATTTTTTCCCATCTCTACgAAATATTTgCCCCTAGAGAAAGGTATAAAACCTTATTATCCA ac a t t ag a a at g t g g c c c c t t t t c t 2730 2740 2750 2760 2770 2780 2790 2800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ******* ***** ** * ** ***** * * * *** * * ** * ** *** * * GAtAATGTAGTTAATCATTACTTCCAAACCAGACACTATTTACATACCCTATGGAAGGCGGGCATCTTATATAAAAGaGA c c g t tc t g tt t g t gc g g g a 2810 2820 2830 2840 2850 2860 2870 2880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** **** ** * ** * ****** * ** * ***** AACTACaCGTAGCGCCTCATTTTgTGGGTCACCTTATTCTTGGGAACAAGAGCTACATCATGGGGCTTTCTTGGACGGTC gt c t c tg t a c t a g cg g a c 2890 2900 2910 2920 2930 2940 2950 2960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * *** * * ** * ***** ** ******** **** ** CCTCTCGAATG---GGGGAAGAATCATTCCACCACCAATCCTCTGGGATTTTTTCCCGACCACCAGTTGGATCCAGCATT a a g t a t g c 2970 2980 2990 3000 3010 3020 3030 3040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** ** * ******** ***** *** *** * * ********** CAGAGCAAACACCAGAAATCCAGATTGGGACCACAATCCCAACAAAGACCACTGGACaGAAGCCAACAAGGTAGGAGTGG ca g t ac tat c t ag cc c 3050 3060 3070 3080 3090 3100 3110 3120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** * * ** * * * ** ** * * ** * * * * ** GAGCATTCGGGCCgGGGTTCACTCCCCCACACGGAGGCCTTTTGGGGTGGAGCCCTCAGGCTCAAGGCATGCTAAAAACA t t t c t g c a c t tagcc tg a c c 3130 3140 3150 3160 3170 3180 3190 3200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * ** * ** * ***** * TTGCCAGCAGATCCGCCTCCTGCCTCCACCAATCGGCAGTCAGGAAGGCAGCCTACCCCAATCACTCCACCTTTGAGAGA g a a a t g a c c 3210 3220 ....:....|....:....|....:.. * * * * CACTCATCCTCAGGCCATGCAGTGGAA g c t g a a c |