Dataset for nucleotide sequence Genomes of genotype E
[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]
10 20 30 40 50 60 70 80 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * *** * * ** * * ** * * * ******* ** * * TTCCACAACATTCCACCAAGCTCTGCAGGATCCCAGAGTAAGAGGCCTGTATtTTCCTGCTGGTGGCTCCAGTTCCGGAA at a g t a a aa ag gcagaat ccc 90 100 110 120 130 140 150 160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** * ** *** * * * ** *** ** * * * * *** * * * ** * CAGTGAACCCTGTTCCGACTACTGCCTCACTCATCTCGTCAATCTTCTCGAGGATTGGGGACCCTGCACCGAACATGGAA a g t t a t g y c 170 180 190 200 210 220 230 240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * **** **** ** ** ******* ** *** * * * * ** ** *** *** ** aGCATCACATCAGGATTCCTAGGACCCCTGCTCGTGTTACAGGCGGGGTTTTTCTTGTTGACAAAAATCCTCACAATACC ga t a a t 250 260 270 280 290 300 310 320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ** **** ************* * ** ***** * ** * ***** ** ** * * ** GCAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGGGAGCTCCCGTGTGTCTTGGCCAAAATTCGCAGTCCC a g a t g t a c 330 340 350 360 370 380 390 400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * ***** ** * *** ** ** * ** * * * **** * *** ** ** * CAAcCTCCAaTCACTCACCAACCTCTTGTCCTCCAATTTGTCCTGGCTATCGCTGGATGTGTCTGCGGCGTTTTATCATC t g t g c g t t t t a 410 420 430 440 450 460 470 480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** ***** * ** * ***** ******* * ** ***** ** ** ** ** ** **** ** *** * * TTCCTCTTCATCCTGCTGCTATGCCTCATCTTCTTGTTGGTTCTTCTGGACTATCAAGGTATGTTGCCCGTTTGTCCTCT c a 490 500 510 520 530 540 550 560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** **** * * * * * ** * * * *** ** * ** ****** ***** AATTCCAGGATCATCAACCACCAGTACGGGACCCTGCCGAACCTGCACGACTCTTGCTCAAGGAACCTCTATGTTTCCCT c cc ta c g ca 570 580 590 600 610 620 630 640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** ** * * ** * *** * * ** ******** ** ** ******** * ***** **** CATGTTGCTGTTCAAAACCTTCGGACGGAAATTGCACTTGTATTCCCATCCCATCATCATGGGCTTTCGGAAAATTCCTA c t t g aa 650 660 670 680 690 700 710 720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **** ******* ******** *** ***** ** ***** ** * ** ** ******** ** ******* ** TGGGAGTGGGCCTCAGCCCGTTTCTCCTGGCTCAGTTTACTAGTGCCATTTGTTCAGTGGTTCGCCGGGCTTTCCCCCAC g t ta t 730 740 750 760 770 780 790 800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * ***** * ** ************* ***** * * ** * ** *** * * *** *** ** TGTCTGGCTTTCAGTTATATGGATGATGTGGTATTGGGGGCCAAGTCTGTACAACATCTTGAGTCCCTTTATACCTCTGT t g gaa c c g a 810 820 830 840 850 860 870 880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ***** ** ** ** **** ** ** * ** * ** * ***** ** * * * **** TACCAATTTTCTTTTGTCTTTGGGTATACATTTAAATcCCAACAAAACAAAAAGATGGGGATATTCCCTaaATTTCATGG k c c g t t ct t c g tt gc c t g a t g c 890 900 910 920 930 940 950 960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * *** *** ** * * ** ** * ** ** * ** *** * ***** ** ** ** GTTATGTAATTGGaAGTTGGGGgTCATTACCACAgGAaCACATCAgAaTGAAAATCAAAGACTGTTTTAGAAAACTCCCT c ca t a c g g a t tca tca c g t cc g c t a c c c c ca 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * * ** ***** * **** * * * ** ** * * *** * ** ** ** ** ***** ** GTTAAcCGGCCTATTGATTGGAAAGTATGTCAAaGAATTGTGGGTCTtTTGGGCTTTGCTGCCCCTTTTACACAATGTGG c ta a c c gc gc c g a t c g g c 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** ** **** * ** * * ** * ***** ** ** ** * ** *** * ** aTATCCTGCTTTAATGCCTCTgTATGCGTGTATTCAATCTAAGCAGGCTTTCACTTTCTCGCCAACTTACAAGGCCTTTC g g t a a a c cc ggac g a t tg t a g a ct c a c r c g 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** ***** ***** * * * *** * * ******** ******** ***** *** TGTGTAAACAATAccTGAACCTTTACCCCGTTGCCCGGCAACGGCCaGGTCTGTGCCAAGTGTTTGCTGATGCAACCCCC a a ccc g taa gc t tac a c t 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** ********* * * * * * ** * ** *** * * ** * ******* ** ***** ACTGGCTGGGGCTTGGCCATAGGCCATCAGCGCaTGCGtGGAACCTTTGTGGCTCCTCTGCCGATCCATACTGCGGAACT t t g at a c a c c a a a g t g c 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** ***** *** **** * **** ** * * ** ** ** ***** ** ** ** ** ** ** * CCTAGCCGCTTGTTTTGCTCGCAGCAGGTCTGGAGCgAAACTTATCGGGACaGATAATTCTGTCGTTCTCTCcCGGAAAT t g a c c g a cc c a a g c c t c a a g t t t c 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * ** ****** **** ** * **** ** *** * ** *********** * * ********* ATACATCaTTTCCATGGCTGCTAGGCTGTGCTGCCAACTGGATCCTGCGAGGGACGTCCTTTGTCTACGTCCCGTCAGCG c c a a aa t g g t t 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * * ****** ** * * ** * * *** * ***** * ** ** **** * * ** CTGAATCCTGCGGACGACCCgTCTCGGGGTCGCTTGGGGaTCTaTCGTCCCCTTCTCCGTCTGCCGTTCCaGCCGACCAC c c c c g t cc a ga at a t g 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** * ** * * * *** * * ****** * ** ** * * ** *** * * *** * * ****** * GGGGCGCACCTCTCTTTACGCGGTCTCCCCGTCTGTgCCTTCTCATCTGCCGGaCCGTGTGCACTTCGCTTCACCTCTGC g a tg a gc c t a g c 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **** ***** ** **** * * * * * *** ** * ** ***** ******* ACGTCGCATGGAGACCACCGTGAACGCCCAC------CAAaTcTTGCCCAAGGTCTTACATAAGAGGACTCTTGGACTCT a c a t aggcga t c t t g 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******** * ******** * **** * *** **** ** * ******** * ******** CtGCAATGTCAACGACCGACCTTGAGGCATACTTCAAAGACTGTTTGTTTAAAGACTGGGAGGAGTtGGGGGAGGAGAtT ag t g c g c cc g 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * *** ****************** **** ** ** * ***** ** **** AGaTTAAaGgTCTTTGTACTAGGAGGCTGTAGGCATAAATTGGTCTGCGCACCAGCACCATGCAACTTTTTCACCTCTGC g c ct a g c c g t t g 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** *** * ** * *** * * ******* ** * ** ***** ******** ** ***** * ** ** CTAATCATCTCTTGTTCATGTCCTACTGTTCAAGCCTCCAAGCTGTGCCTTGGGTGGCTTTgGGgCATGGACATTGACCC a a c t r y 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******* ******* * * * ** ******** ** ** * ** * * ** * TTATAAAGAATTTGGAGCTaCTGTGGAGTTACTCTCGTTTTTGCCTTCTGACTTCTTTCCTTCAGTAAGAGATCTTCTAG gtg c t ggac t t a ag ca t ag t w a ag c 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * ** * * ** * * **** ATACCGCCTCaGCTCTGTATCGGGATGCCTTAGAATCTCCTGAGCATTGTTCACCtCACCAcACtGCACTCAGGCAAGCC t ac t t c t g g t a ca gyg t ct g ta t a c c a c a 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * *** * * * ** **** ** ** ** * * ** * ** * ATTCTTTGCTGGGGgGAacTAATGAcTCTAGCTACCTGGGTGGGtGtAAATTTGGAAGATCCAGCATCCAGGGACCTAGT g a g t a ct t tact gc gact c ac c c act c t a atat t tg g a g a a t g a a 2170 2180 2190 2200 2210 2220 2230 2240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ***** ** * * * * ** * * ** ** ** * ** ** AGTCAGTTATGTCAATACTAATATGGGCCTAAAGTTCAGGCAATTATTGTGGTTTCACATTTCTTGTCTCACTTTTGGAA g tg c t cga c g cat a t a c t c ca t tg c g t a g 2250 2260 2270 2280 2290 2300 2310 2320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * ** ** ** * ** * *** * ******* * ** * ** ********* GAGAAACcGTCaTAGAGTATTTGGTGTCTTTTGGAGTGTGGATTCGCACTCCTCCAGCTTATAGACCACCAAATGCCCCT c tgtt tt t tc a c attc c g g a c a g ac c 2330 2340 2350 2360 2370 2380 2390 2400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * * *** ** * ***** ***** *** * **** * ******* ** ATCTTATCAACACTTCCGGAGAaTACTGTTGTTAGACGAAGAG------GCAGGTCCCCTAGAAGAAGAACTCCCTCGCC c t a c a c c c a t t 2410 2420 2430 2440 2450 2460 2470 2480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** * ** *** ** *** * ** **** *** * * * * * *** ** * * * TCGCAGACGAAGATCTCAATCGCCGCGTCGCAGAAGATCTCAATCTCCAGCTTCCCAATGTTAGTATTCCTTGGACTCAC c c tg aagc a g t 2490 2500 2510 2520 2530 2540 2550 2560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** **** * ** * ** *** * * ***** * * ** * * ** ** AAGGTGGGAAATTTTACGGGGCTTTAcTCTTCTACTATACCTGTCTTTAATCCTAACTGGAAAACTCCATCTTTTCCTGA g t a c t t a t cg c t t c aa c c 2570 2580 2590 2600 2610 2620 2630 2640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** * * ** ** * * * ** * ** * ** ** ** * ** * * * * * * * TATTCATTTGCACCAGGACATTATTAACAAATGTGAACAATTTGTAGGTCCTCTAACAGTAAATGAAAAACGAAGATTAA c a a t c g t g g g c ct g t a gc gc t 2650 2660 2670 2680 2690 2700 2710 2720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ***** * * ** ***** ** ** ** * ** ** ** * ** * ** ** ** AcTTAGTcATGCCTGCTAGATTTTTTCCCATCTCTACgAAATATTTgCCCCTAGAGAAAGGTATAAAACCTTATTATCCA tc a t t ag a a at g t g g c c c a t t t c t 2730 2740 2750 2760 2770 2780 2790 2800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ******* ***** ** * ** ***** * * * *** * * ** * ** *** * * GAtAATGTAGTTAATCATTACTTCCAAACCAGACACTATTTACATACCCTATGGAAGGCGGGCATCTTATATAAAAGaGA c c g t tc t g c tt t g tg gc g g g a 2810 2820 2830 2840 2850 2860 2870 2880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** **** ** ** ** ** ****** * ** * ***** AACTACaCGTAGCGCCTCATTTTgTGGGTCACCTTATTCTTGGGAACAAGAGCTACATCATGGGGCTTTCTTGGACGGTC gt c a t c tg t a c c a g a cg g ac t 2890 2900 2910 2920 2930 2940 2950 2960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * *** * * ** * ***** ** ******** **** ** CCTCTCGAATG---GGGGAAGAATCATTCCACCACCAATCCTCTGGGATTTTTTCCCGACCACCAGTTGGATCCAGCATT a a t g t a t t g a c 2970 2980 2990 3000 3010 3020 3030 3040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** ** ********** ****** * **** * *** * * ********** CAGAGCAAACACCAGAAATCCAGATTGGGACCACAATCCCAACAAAGACCACTGGACaGAAGCCAACAAGGTAGGAGTGG ca g ac tat c t ag cc c 3050 3060 3070 3080 3090 3100 3110 3120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** * * ** * * * ** ** * * ** * * * * * ** GAGCATTcGGGCCgGGGTTCACTCCCCCACACGGAGGCCTTTTGGGGTGGAGCCCTCAGGCTCAAGGCATGCTAAAAACA t t t c t g t c a c t g tagcc tg a c c t 3130 3140 3150 3160 3170 3180 3190 3200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * * * ** * ** * ***** * TTGCCAGCAGATCCGCCTCCTGCCTCCACCAATCGGCAGTCAGGAAGGCAGCCTACCCCAATCACTCCACCTTTGAGAGA g a at t t a a c 3210 3220 ....:....|....:....|....:.. * * * * ** * CACTCATCCTCAGGCCATGCAGTGGAA g c t g a a c |