Dataset for nucleotide sequence PreS1 of genotype A
[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]
10 20 30 40 50 60 70 80 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * ** * * ** * * ** ATGGGAGGTTGGTCAtCaAAACCTCGCAAAGGCATGGGGACGAAtCTTTCTGTTCCCAAcCCTCTGGGATTCTTTCCCGA at c c cg c a c a t g tc c g g g 90 100 110 120 130 140 150 160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * * ** * * * * ** ** * * ** TCATCAGTTGGACCCTGCATTCGGAGCCAAcTCAAACAATCCAGATTGGGACTTCAACCCCATCAAGGACCACTGGCCAg ac t g t g c t a gc a t t c a a c 170 180 190 200 210 220 230 240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * ** * * * ** * * * cAGCCAAcCAGGTAGGAGTGGGAGCATTCGGGCCAGGGcTCACcCCtCCACACGGcGGTaTTTTGGGGTGGAGCCCTCAG a t g t c t t c a g cc 250 260 270 280 290 300 310 320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * GCTCAGGGCATATTGaCcACAGTGtCAaCAaTTCCTCCTCCTGCCTCCACCAATCGGCAGTCAGGAAGGCAGCCTACTCC a cgc g tcatt c ggt g g ca g a a c a a 330 340 350 360 370 380 390 400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| CATCTCTCCACCTCTAAG------AGACAGTCATCCTCAGGCCATGCAGTGGAATTCCACtGCcTTCCACCAAGCTCTGC t g c agca a c cc g aa t t a a g aa a 410 420 430 440 450 460 470 480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * * ** * AgGATCCCAGAGTCAGGGGtCTGTATtTTCCTGCTGGTGGCTCCAGTTCAGGAACAgTaAACCCTGcTCCgAATATTGCC a c ag a c c c t c c t aa c c ta c 490 500 510 520 530 540 550 560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * * * * * * ** * * TCTCACATCTCGTCAATCTCCgCGAGGACTGGGGACCCTGtgaCGAACATGGAGAACATCACATCAGGATTCCTAGGACC a c t c t cacta c c a tt g 570 580 590 600 610 620 630 640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * ** * * * * ** ** * *** * ** * * * CCTGCTCGTGTTACAGGCGGGGTTTTTCTTGTTGACAAGAATCCTCACAATACCGCAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTT c a a 650 660 670 680 690 700 710 720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * ** * * ***** *** * ** * ** ** ** CTCTCAATTTTCTAGGGGGatCACCCGTGTGTCTTGGCCAAAATTCGCAGTCCCCAACCTCCAATCACTCACCAACCTCC g acc ta a g t gg 730 740 750 760 770 780 790 800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * * * * * * * * ** * ** ** ** ** *** * ** *** TGTCCTCCAATTTGTCCTGGTTATCGCTGGATGTGTCTGCGGCGTTTTATCATATTCCTCTTCATCCTGCT---GCTATG c c t 810 820 830 840 850 860 870 880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * * CCTCATCTTCTTATTGGTTCTTCTGGATTATCAAGGTATGTTGCCCGTTTGTCCTCTAATTCCAGGATCaA------caa g a c gc g cgcaacaa--- - 890 900 910 920 930 940 950 960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** * * * *** * ** * ** CAACCAGtACGGGACCaTGCAAAACCTGCACGACTCCTGCTCAAGGCAACTCTATGTTTCCCTCATGTTGCTGTACAAAA -c c a c gg c a t 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * * **** * * * ** * * ** * * ** *** * * * ** CCTACGGAtGGAAATTGCACCTGTATTCCCATCCCATCgTCcTGGGCTTTCGCAAAATACCTATGGGAGTGGGCCTCAGT t c t a t t g c 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** * * * * * * * * * * * * * * CCGTTTCTCtTGGCTCAGTTTACTAGTGCCATTTGTTCAGTGGTTCGTAGGGCTTTCCCCCACTGTTTGGCTTTCAGcTA a c c t t c 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * * TaTGGATGATGTGGTAtTGGGGGCCAAGTCTGTACAgCATCgTGAGtCCCTTTATACCGCTGTTACCAATTTTCTTTTGT g a t tc aa cg a c t ag t t a t t c t 1210 ....:....|....:... CTcTGGGTATACATTTAA t c c |