Dataset for nucleotide sequence Genomes of genotype A
[Download (right click)] [Download Frequencies (right click)] [Sequences] [Alignment]
10 20 30 40 50 60 70 80 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * * *** TTCCACtGCcTTCCACCAAGCTCTGCAgGATCCCAGAGTCAGGGGtCTGTATtTTCCTGCTGGTGGCTCCAGTTCAGGAA c aa t t t a g aa a ag a c --- c c a 90 100 110 120 130 140 150 160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * * * * * * * * ** * ** CAgTaAACCCTGcTCCgAATATTGCCTCTCACATCTCGTCAATCTCCgCGAGGACTGGGGACCCTGtgaCGAACATGGAG t c c g t aa c c ta a a c t c t cact c t c a tt g 170 180 190 200 210 220 230 240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * * * ** * * ** * ** ** * ** ** * *** * *** * AACATCACATCAGGATTCCTAGGACCCCTGCTCGTGTTACAGGCGGGGTTTTTCTTGTTGACAAGAATCCTCACAATACC c a c a 250 260 270 280 290 300 310 320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** *** ** ** ** ** * ** * * *** *** *** ***** ** GCAGAGTCTAGACTCGTGGTGGACTTCTCTCAATTTTCTAGGGGGatCACCCGTGTGTCTTGGCCAAAATTCGCAGTCCC a g acc ta g gg a 330 340 350 360 370 380 390 400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| **** ** ***** ** *** * * ** *** * ** *** * * ** * ** CAACCTCCAATCACTCACCAACCTCCTGTCCTCCAATTTGTCCTGGTTATCGCTGGATGTGTCTGCGGCGTTTTATCATA t c c t a 410 420 430 440 450 460 470 480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ***** ** *** * ** *** * * ** * ** * * * * TTCCTCTTCATCCTGCT---GCTATGCCTCATCTTCTTATTGGTTCTTCTGGATTATCAAGGTATGTTGCCCGTTTGTCC g a g c gc g 490 500 510 520 530 540 550 560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * ** * * ** ** * * *** * TCTAATTCCAGGATCaACAACAACCAGtACGGGACCaTGCAAAACCTGCACGACTCCTGCTCAAGGCAACTCTATGTTTC c a c c c a c gg g c t 570 580 590 600 610 620 630 640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** ** **** * * ** * * **** * * * **** ** *** ** * ** * * CCTCATGTTGCTGTACAAAACCTACGGAtGGAAATTGCACCTGTATTCCCATCCCATCgTCcTGGGCTTTCGCAAAATAC c t c t c t a t t a 650 660 670 680 690 700 710 720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ******* * * ***** ** * * * ** ** ** ** * * * * ** * * * * ** CTATGGGAGTGGGCCTCAGTCCGTTTCTCtTGGCTCAGTTTACTAGTGCCATTTGTTCAGTGGTTCGTAGGGCTTTCCCC g c a c c c 730 740 750 760 770 780 790 800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * *** ** ** * * * ** ** * * * * ** * * ** CACTGTTTGGCTTTCAGcTATaTGGATGATGTGGTAtTGGGGGCCAAGTCTGTACAgCATCgTGAGtCCCTTTATACCGC t c t t g a c tc aa g a c t ag t t r 810 820 830 840 850 860 870 880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ***** * **** * ** * * *** * **** ** * * TGTTACCAATTTTCTTTTGTCTcTGGGTATACATTTAAACCCTAACAAAACAAAaAGATGGGGTTATTCCCTaAAcTTCA t t c c t t g c c gc t t c t 890 900 910 920 930 940 950 960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * * * * * ** * * * * * * ** ** TGGGtTAcaTAATTGGAAGTTGGGGaACaTTGCCACAgGATCATATTGTACAAAAgATCAAAcACTGTTTTAGAAAACTT a tg c tt tc a a g a g ac t agt cc g g g g g t a c c g 970 980 990 1000 1010 1020 1030 1040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * * ******* ** ** * * * * ** * * * * * ** ** CCTGTtAAcaGgCCTATTGATTGGAAAGTATGTCAaAGaATTGTGGGTCTTTTGGGCTTTGCtGCtCCATTTACACAATG ca c tc a g c g gc g a c c a c c a c a c 1050 1060 1070 1080 1090 1100 1110 1120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** ** * * ** * ** * ** ** * * * * * * ** * ** TGGaTAtCCTGCcTTAATGCCTTTGTATGCATGTATACAAGCtAAACAGGCTTTcACTTTCTCGCCAACTTACAAGGCCT t c g a cc a g g gg t t g t a 1130 1140 1150 1160 1170 1180 1190 1200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** * * * * * * * ** ** * ** ** ** * ** ** *** TTCTAAGTaAACAGTAcATGAACCTTTACCCCGTTGCtCGGCAACGGCCTGGTCTGTGCCAAGTGTTTGCTGACGCAACC gca ccc a tc g c t c a t t 1210 1220 1230 1240 1250 1260 1270 1280 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| *** ** ***** * * * ** * * **** ** * * * ** * ** ***** ** ** CCCACTGGcTGGGGCTTGGCcATaGGCCATCAGCGCATGCGTGGAACCTTTGTGGCTCCTCTGCCGATCCATACTGCGGA t t c a c g t 1290 1300 1310 1320 1330 1340 1350 1360 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * * * * ** ** * ** * * * * * * * * * ACTCCTAGCcGCTTGTTTTGCTCGCAGCCGGTCTGGAGCAAAgCTCATcGGaACTGAcAATTCTGTCGTCCTcTCgCGGA t c a g g ca a g t t t a c t c 1370 1380 1390 1400 1410 1420 1430 1440 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** * * *** * *** *** ** * * ** * ** AATATACATCgTTTCCATGGCTGCTAGGcTGTACTGCCAACTGGATcCTTCGCGGGACGTCCTTTGTTTACGTCCCGTCG c a c t g t a a c t a c g a t 1450 1460 1470 1480 1490 1500 1510 1520 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ****** * ** ** ** ** * * * * ** ** ** ** * * * * GCGCTGAATCCCGCGGACGACCCCTCtCGgGGCCGCTTGGGaCTCTcTCGTCCCCTTCTCCGTCTGCCGTtCCagCCGAC t t ga a t t ga g a at gt t a c c t a c t 1530 1540 1550 1560 1570 1580 1590 1600 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * *** ** ** * * ** **** CACGGGGCGCACCTCTCTTTACGCGGTCTCCCCGTCTGTGCCTTCTCATCTGCCGGtCCGTGTGCACTTCGCTTCACCTC a c a a 1610 1620 1630 1640 1650 1660 1670 1680 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * *** * * * * ** ** * ** * * * TGCACGTTGCATGGaGACCACCGTGAACGC------CCATCAGATCCTGCCCAAGGTCTTACATAAGAGGACTCTTGGAC ca c agg t t c 1690 1700 1710 1720 1730 1740 1750 1760 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ********* * ****** * * * * * **** ** TCCCAGCAATGTCAACGACCGACCTTGAGGCCTACTTCAAAGACTGTGTGTTTAAgGACTGGGAGGAGcTGGGGGAGGAG t t t a a at a 1770 1780 1790 1800 1810 1820 1830 1840 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ** ATTAGGTTAAaGgTCTTTGTAT------------TAGGAGGCTGTAGGCAt---AAATTGGTCTGCGCACCAgCAcCATG cg c t a t a --t at- g tt ttct c a c t 1850 1860 1870 1880 1890 1900 1910 1920 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * *** * * *** * * * ** *** CAACTTTTTCACCTCTGCCTAATCATCTCTTGTaCATGTCCCACTgTTCAAGCCTCCAAGCTGTGCCTTGGgTGGCTTTG c t t t a a c t 1930 1940 1950 1960 1970 1980 1990 2000 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * **** * *** * * * * ** * * ** * * * * * ** GGGCATGGACATTGACCCTTATAAAGAATTTGGAGCTACTGTGGAGTTACTCTCgTTTTTGCCTTCTGACTTCTTTCCTT a c g t c a t a ca t t a t g a 2010 2020 2030 2040 2050 2060 2070 2080 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** * * * * * * ** CcGTCaGaGATCTcCTaGAcACcGCCTCAGCTCTgTATCGaGAAGCCTTAGAGTCTCCTGAGCATTGCTCACCTCACCAT a cac g a t t a a t a t g t ac g a a g ta cg g t t t g t t c t 2090 2100 2110 2120 2130 2140 2150 2160 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** * **** * * **** ** ** * ACtGCACTCAGGCAAGCCATTCTCTGCTGGGGGGAATTgATGACTCTAGCTACCTGGGTGGGTAATAATTTGgAAGATCC a a ag g a t tg a c a t gct t c c ac c c a c t cc 2170 2180 2190 2200 2210 2220 2230 2240 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * ** * ** ** * * * ** * * AGCATCcAGGGATCTAGTAGTcAATTATGTTAATACTAACATGGGttTAAAgATcAGgCAACTATTGTGGTTTCATATaT t a a ta a c c a c t cc a t a t g ct t t a c 2250 2260 2270 2280 2290 2300 2310 2320 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** ** * * * ** * * ** * *** * * ** ** CTTGCCTTACTTTTGGAAGAGAgACTGTaCTTGAaTATTTGGTCTCTTTcGGAGTGTGGATTCGCACTCCTCCAGCCTAT c ta c c c agtg ca g a t c t g a c t c t t a a c g 2330 2340 2350 2360 2370 2380 2390 2400 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** ********* **** **** * * ** * ** * AGACCACCAAATGCCCCTATCTTATCAACACTTCCGGAAACTACTGTTGTTAGACGACGgGACCGA---GGCAGGTCCCC t g a tata a-g--- c tc a - - a 2410 2420 2430 2440 2450 2460 2470 2480 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * ** **** ** * ** ** ** * ** **** ** TAGAAGAAGAACTCCCTCGCCTCGCAGACGcAGATCTCAATCGCCGCGTCGCAGAAGATCTCAATCTCGGGAATCTCAAT c a a a g c c 2490 2500 2510 2520 2530 2540 2550 2560 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * ** ** ** * * ** * ** ** ** ** ** ** * ** GTTAGTATTCCTTGGACTCATAAGGTGGGAAAcTTtACtGGGCTTTATTCcTCTACaGTaCCTATCTTTAATCCTGAATG c g t c g a c c t t c gat c c g g t t 2570 2580 2590 2600 2610 2620 2630 2640 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** * ** ** * * * ** * * ** * * GCAAACTCCTTCcTTTCCTAAgATTCATTTACAaGAgGACATTatTAATAGGTGTCAaCAATTTGTgGGCCCTCTcACTG g c c t a a c t a t gccg c a g g c a t t a g c c t a c c g 2650 2660 2670 2680 2690 2700 2710 2720 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * * * *** * * * * * * ** * * * * TAAATGAAAAgAGAAGAtTgAAATTAATTATGCCTGCTAGaTTcTATCCTAcCcaCACtAAATATTTgCCctTAGACAAA cg a g c a g g c c g t c atagt c g c a tc gc t a c a 2730 2740 2750 2760 2770 2780 2790 2800 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** ** * * ** * * ** *** * * * * ** GGaATTAAACCTTATTATCCaGATCAgGTAGTTAATCATTACTTcCAaACCaGACATTATTTACATACTCTTTGGAAGGC g g t a ta g t ta gg tc g c c a a g 2810 2820 2830 2840 2850 2860 2870 2880 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| ** * * * * * * * * * * ** ******* * * TGGtATTCTATATAAGAGGGAAACcACACGTAGCGCaTCATTTTGCGGGTCACCATATTCTTGGGAACAAGAGCTACAgC g gg ct c a t t t c c t c c t a t 2890 2900 2910 2920 2930 2940 2950 2960 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * ** * * * * *** ATGGGAGGTTGGTcAtCaAAACCTCGCAAAGGCATGGGGACGAAtCTTTCTGTTCCCAAcCCTCTGGGATTCTTTCCCGA ------------at-c-c-c------------- c a g ct a t g c -- g - - g - g 2970 2980 2990 3000 3010 3020 3030 3040 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * ** * * * ** * * * * ** ** * ** * ** TCATCAGTTGGACCCTGCATTCGGAGCCAAcTCAAACAATCCAGATTGGGACTTCAACCCCATCAAGGACCACTGGCCAg ac t g t c t a gc a t t c c a 3050 3060 3070 3080 3090 3100 3110 3120 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * * ** * * ** ** ** * * * ** cAGCCAAcCAGGTAGGAGTGGGAGCATTCGGGCCAGGGcTCACcCCtCCACACGGcGGTaTTTTGGGGTGGAGCCCTCAG ag t a g t c at t c a cg cc c 3130 3140 3150 3160 3170 3180 3190 3200 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|....:....| * * * ***** ** ** * GCTCAGGGCATATTGaCcACAGTGtCAaCAaTTCCTCCTCCTGCCTCCACCAATCGGCAGTCAGGAAGGCAGCCTACTCC a cgc g t tt c ggt g g ca t g a c a c a a g 3210 3220 3230 3240 3250 ....:....|....:....|....:....|....:....|....:....|.... * * * ** CATCTCTCCACCTCTAAG------AGACAGTCATCCTCAGGCCATGCAGTGGAA t c c agca a --- a |